26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3417 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3417  leucine aminopeptidase  100 
 
 
339 aa  710    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  50.45 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  52.65 
 
 
343 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  54.08 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  46.48 
 
 
333 aa  276  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  43.28 
 
 
336 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  34.56 
 
 
304 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  32.77 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  32.39 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  30.42 
 
 
319 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  25.39 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  25.47 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  25.66 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.15 
 
 
775 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.67 
 
 
598 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  29.14 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.66 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  24.26 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  30.88 
 
 
330 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  30.63 
 
 
273 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  29.73 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  29.73 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  27.35 
 
 
1247 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  27.32 
 
 
584 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02870  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  26.95 
 
 
282 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>