42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1495 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  100 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  61.06 
 
 
223 aa  252  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  54.19 
 
 
225 aa  221  8e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  44.75 
 
 
218 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  44.75 
 
 
218 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  44.75 
 
 
218 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  42.73 
 
 
219 aa  181  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  45.24 
 
 
219 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  43.75 
 
 
224 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  41.1 
 
 
219 aa  174  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  40.72 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  41.1 
 
 
219 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  42.45 
 
 
224 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  44.17 
 
 
219 aa  167  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  43.24 
 
 
223 aa  167  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  42.01 
 
 
224 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  42.01 
 
 
224 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  42.01 
 
 
224 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  41.89 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  43.26 
 
 
221 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  40.91 
 
 
221 aa  157  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  41.94 
 
 
220 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  39.23 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  38.99 
 
 
221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  40.7 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  41.38 
 
 
224 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  40.91 
 
 
228 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  40.91 
 
 
228 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  40.91 
 
 
224 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  40.91 
 
 
224 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  40.91 
 
 
224 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  40.91 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  40.91 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  40.94 
 
 
169 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  36.22 
 
 
214 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  27.88 
 
 
230 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  31.9 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  30.95 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  30.14 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  30.95 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  29.02 
 
 
202 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  29.36 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>