45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0882 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  61.06 
 
 
224 aa  264  8e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  58.22 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  47.69 
 
 
218 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  47.69 
 
 
218 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  47.69 
 
 
218 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  46.76 
 
 
219 aa  208  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  47.78 
 
 
224 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  47.34 
 
 
224 aa  205  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  47.44 
 
 
219 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  47.91 
 
 
219 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  45.16 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  48.98 
 
 
225 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  50.24 
 
 
219 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  49.76 
 
 
221 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  48.77 
 
 
219 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  44.91 
 
 
219 aa  191  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  42.6 
 
 
223 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  45.24 
 
 
224 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  48.61 
 
 
221 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  42.86 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  42.86 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  48.13 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  42.86 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  45.45 
 
 
221 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  44.83 
 
 
224 aa  175  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  44.95 
 
 
228 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  44.95 
 
 
228 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  44.95 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  44.95 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  44.95 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  44.95 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  44.95 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  49.11 
 
 
169 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  32.21 
 
 
211 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  33.8 
 
 
214 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  35.38 
 
 
224 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  35.38 
 
 
231 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  34.36 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  25.85 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  25.29 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  28.46 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  28.21 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>