18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0049 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  100 
 
 		 558 aa  1140    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  27.82 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  20.71 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2370  AAA ATPase  26.42 
 
 		 454 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  22.66 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  24.26 
 
 		 544 aa  50.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  31.85 
 
 		 353 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  25.85 
 
 		 518 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  51.16 
 
 		 586 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  29.55 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.52 
 
 		 623 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  25.4 
 
 		 382 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  25.4 
 
 		 382 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  47.83 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.07 
 
 		 597 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  47.83 
 
 		 399 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  41.67 
 
 		 435 aa  44.3  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  42.55 
 
 		 496 aa  43.9  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>