38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1423 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1423  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320561  normal  0.653719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  53.49 
 
 		 221 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  50.46 
 
 		 272 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  34.02 
 
 		 349 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  31.65 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  31.65 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  26.09 
 
 		 570 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  26.52 
 
 		 542 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  25 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  25 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  28.28 
 
 		 329 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  27.17 
 
 		 342 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  26.81 
 
 		 362 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  23.33 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  26.74 
 
 		 359 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  27.89 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  24.29 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  23.03 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  24.58 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  24.71 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  23.49 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  23.97 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.17 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  21.97 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  26.67 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.17 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  21.26 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  23.49 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  23.49 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  24.34 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  23.85 
 
 		 267 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>