30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5258 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  5.11759e-12  normal  0.636992 
 
 
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  87.9 
 
 
144 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  87.1 
 
 
144 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  87.1 
 
 
144 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  77.17 
 
 
145 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  5.87012e-10  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2408  hypothetical protein  63.12 
 
 
151 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2516  hypothetical protein  63.12 
 
 
151 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2366  hypothetical protein  63.12 
 
 
151 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456188  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3315  hypothetical protein  62.41 
 
 
151 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0170316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1993  hypothetical protein  62.41 
 
 
151 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1496  hypothetical protein  62.41 
 
 
151 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639522  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2084  hypothetical protein  61.94 
 
 
191 aa  160  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  45.93 
 
 
165 aa  115  4e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  43.36 
 
 
136 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  46.32 
 
 
141 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  44.06 
 
 
140 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  40.85 
 
 
138 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  40.59 
 
 
121 aa  75.1  5e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  42.16 
 
 
150 aa  73.9  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  35.07 
 
 
139 aa  73.6  1e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  36.73 
 
 
139 aa  69.7  2e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  32.56 
 
 
144 aa  67  1e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  38.46 
 
 
149 aa  67  1e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  34.42 
 
 
160 aa  65.5  4e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  36.54 
 
 
146 aa  63.5  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  63.5  1e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  37.93 
 
 
153 aa  62  5e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  38.64 
 
 
161 aa  59.7  2e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  30.33 
 
 
129 aa  52  4e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  30.43 
 
 
153 aa  51.6  6e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>