19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4942 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  1.58871e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5346  hypothetical protein  99.11 
 
 
112 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0749  hypothetical protein  89.43 
 
 
166 aa  231  2e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4399  hypothetical protein  81.65 
 
 
112 aa  195  2e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  44.23 
 
 
683 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  44.26 
 
 
149 aa  50.8  5e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  51.28 
 
 
254 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  52.94 
 
 
644 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  48.89 
 
 
388 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  48.89 
 
 
388 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0393  hypothetical protein  35 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  37.74 
 
 
643 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  46 
 
 
284 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2694  putative cytochrome c family protein  35.29 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.97531  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  44.64 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.6 
 
 
293 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.86 
 
 
325 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0404  hypothetical protein  37.04 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>