More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4217 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.27 
 
 
656 aa  1005    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  50 
 
 
643 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.11 
 
 
656 aa  1003    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.11 
 
 
656 aa  1005    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  90.53 
 
 
655 aa  1215    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  50.61 
 
 
651 aa  688    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.93 
 
 
650 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5373  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  57.53 
 
 
676 aa  730    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.11 
 
 
656 aa  1005    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.27 
 
 
656 aa  1005    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  94.97 
 
 
656 aa  1248    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2478  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.55 
 
 
660 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.669542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  93.58 
 
 
655 aa  1258    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2172  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  49.93 
 
 
665 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.71793  hitchhiker  0.0000206838 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.11 
 
 
656 aa  1005    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1749  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.11 
 
 
656 aa  988    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  99.69 
 
 
655 aa  1323    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.7 
 
 
656 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  95.27 
 
 
656 aa  1254    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.6 
 
 
639 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
655 aa  1328    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  95.27 
 
 
656 aa  1254    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3228  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.68 
 
 
653 aa  632  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  52.14 
 
 
656 aa  628  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  46.33 
 
 
637 aa  602  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  46.18 
 
 
637 aa  598  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0241  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.15 
 
 
654 aa  598  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.148011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2639  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.09 
 
 
647 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  47.7 
 
 
643 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1548  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  47.32 
 
 
647 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545574  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  45.79 
 
 
637 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.665641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  47.66 
 
 
658 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04798  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  46.2 
 
 
646 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0146  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  42 
 
 
652 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.38 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0474  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.05 
 
 
633 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.03 
 
 
629 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.6 
 
 
629 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.53 
 
 
633 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.36 
 
 
625 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.98 
 
 
632 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.8 
 
 
638 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.48 
 
 
639 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1324  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  33.85 
 
 
622 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0358  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.45 
 
 
697 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.395531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.31 
 
 
646 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  39.31 
 
 
643 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.18 
 
 
637 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.69 
 
 
635 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.31 
 
 
634 aa  389  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.8 
 
 
647 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.45 
 
 
629 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.52 
 
 
641 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.04 
 
 
615 aa  379  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.08 
 
 
628 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.02 
 
 
633 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.85 
 
 
629 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.92 
 
 
631 aa  369  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.48 
 
 
630 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.88 
 
 
641 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.02 
 
 
643 aa  365  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  37.29 
 
 
642 aa  361  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.27 
 
 
622 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.72 
 
 
619 aa  353  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.58 
 
 
620 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.92 
 
 
625 aa  342  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.58 
 
 
634 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1353  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.35 
 
 
632 aa  337  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.1901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 
633 aa  334  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  33.55 
 
 
630 aa  333  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.69 
 
 
634 aa  333  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
633 aa  333  8e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
633 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
633 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  32.92 
 
 
633 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  32.92 
 
 
633 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
633 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
633 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
633 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.14 
 
 
639 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.98 
 
 
633 aa  330  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.58 
 
 
632 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.14 
 
 
619 aa  327  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.82 
 
 
632 aa  326  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1611  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.06 
 
 
600 aa  325  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.69 
 
 
635 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12229  asparagine synthetase asnB  36.83 
 
 
652 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.128709  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.74 
 
 
605 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0497  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.44 
 
 
630 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0431896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1366  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.6 
 
 
642 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.51 
 
 
649 aa  317  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.93 
 
 
627 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3361  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  34.94 
 
 
655 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3299  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  34.94 
 
 
655 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3310  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  34.94 
 
 
655 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959151  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2948  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.87 
 
 
614 aa  312  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 
610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3554  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.61 
 
 
640 aa  308  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 
635 aa  306  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.64 
 
 
626 aa  306  7e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>