More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1472 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
172 aa  348  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  91.86 
 
 
172 aa  317  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  78.49 
 
 
171 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  77.33 
 
 
171 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  77.33 
 
 
171 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  74.42 
 
 
171 aa  260  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 
188 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  46.01 
 
 
174 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  46.01 
 
 
174 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  44.08 
 
 
185 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
181 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  36.49 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2282  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0914667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2776  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000291  putative acetyltransferase  34.36 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06093  hypothetical protein  31.9 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  26.49 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5559  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  31.01 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3652  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390666  normal  0.0966919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28 
 
 
547 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13780  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.72 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  28.86 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  28.86 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  30.12 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6162  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
166 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  26.16 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2137  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  35.44 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3123  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
249 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03210  acetyltransferase  29.63 
 
 
193 aa  58.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  29.17 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3082  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
241 aa  58.2  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314403  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
165 aa  57.4  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6402  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0913  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2415  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00150831  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0821  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
249 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1925  putative acetyltransferase  28.12 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01810  acetyltransferase (GNAT) family protein  27.37 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
173 aa  55.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
174 aa  54.3  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
168 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0133  acetyltransferase  39.02 
 
 
144 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2958  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0822449  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  24.11 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000138453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1252  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216014  decreased coverage  0.00258984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0811  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214529 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0526  acetyltransferase  27.81 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.012203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1837  hypothetical protein  23.94 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1811  acetyltransferase  23.94 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1794  acetyltransferase  23.94 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000558014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  28.48 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2015  hypothetical protein  23.94 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2608e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1980  hypothetical protein  23.94 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0406169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  26.71 
 
 
161 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
164 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
148 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1091  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
163 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.745657  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
177 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>