120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2958 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2958  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
152 aa  314  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0822449  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  61.84 
 
 
152 aa  204  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.934775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  62.76 
 
 
151 aa  193  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4380  GCN5-related N-acetyltransferase  57.24 
 
 
167 aa  190  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  61.38 
 
 
148 aa  183  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146915  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2643  acetyltransferase  44.78 
 
 
135 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4143  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
150 aa  90.5  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1580  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202356  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0083  acetyltransferase  29.05 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108179  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0133  acetyltransferase  31.91 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3222  acetyltransferase  32.03 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1578  acetyltransferase  30.6 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2232  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  31.16 
 
 
297 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4054  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.236772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3360  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0634  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.581796 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2026  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
327 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1835  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0223571  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.881941  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1382  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
294 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37660  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  27.27 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02870  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11780)  26.56 
 
 
366 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.47 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23330  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.91 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0189427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.68 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0913  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2795  acetyltransferase  26.17 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  31.31 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2399  putative acetyltransferase  37.68 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28.4 
 
 
547 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1217  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 
204 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4090  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  29.81 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0877  acetyltransferase  32.91 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1231  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
210 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.937528  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000469355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  26.13 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  30.93 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
171 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.69 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.69 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  35.94 
 
 
444 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.33 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  26.87 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1930  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525718  hitchhiker  0.000000154732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2746  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000002917 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  24.39 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  28.09 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.22 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  48.78 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3429  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  35.38 
 
 
297 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  32.5 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  32.59 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
154 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  24.67 
 
 
176 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12684  hypothetical protein  26.5 
 
 
156 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
187 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4141  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
167 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
151 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.66 
 
 
138 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
176 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.9 
 
 
147 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.77 
 
 
147 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.24 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  23.72 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0339934  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.92 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.72 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.72 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2602  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229806  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.9 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0105  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1499  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0364311  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06171  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.856364  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05881  putative acetyltransferase  32.1 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.38 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00161881  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1892  acetyltransferase  32.1 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02547  hypothetical protein  28.67 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  31.75 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.43 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>