More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2900 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  64.86 
 
 
497 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2900  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  1001    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2984  aldehyde dehydrogenase  95.77 
 
 
496 aa  894    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  88.91 
 
 
496 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  88.91 
 
 
496 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  85.71 
 
 
497 aa  841    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  88.91 
 
 
528 aa  867    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  80.85 
 
 
496 aa  782    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  96.37 
 
 
496 aa  918    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  64.86 
 
 
526 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  88.71 
 
 
496 aa  869    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  64.46 
 
 
497 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2990  aldehyde dehydrogenase  96.57 
 
 
496 aa  917    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  83.9 
 
 
497 aa  845    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3010  aldehyde dehydrogenase  96.57 
 
 
496 aa  917    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  79.84 
 
 
496 aa  762    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2376  aldehyde dehydrogenase  96.57 
 
 
496 aa  917    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3037  aldehyde dehydrogenase  98.99 
 
 
496 aa  992    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  84.1 
 
 
497 aa  837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  63.64 
 
 
495 aa  634  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  64.26 
 
 
497 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  63.99 
 
 
496 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  62.45 
 
 
499 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  62.65 
 
 
497 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  63.45 
 
 
497 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  62.65 
 
 
497 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  63.25 
 
 
497 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  60.64 
 
 
497 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  62.15 
 
 
496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  61.59 
 
 
498 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  61.99 
 
 
498 aa  598  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
498 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  61.38 
 
 
498 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  60.49 
 
 
499 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  61.59 
 
 
498 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  59.96 
 
 
498 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
498 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
498 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  60.12 
 
 
499 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  59.72 
 
 
498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48030  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  64.46 
 
 
497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  59.76 
 
 
498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  59.76 
 
 
498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  60.12 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  60.9 
 
 
498 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  58.79 
 
 
503 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  62.32 
 
 
499 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0298  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  62.53 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  59.43 
 
 
511 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
497 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  55.35 
 
 
496 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  57.64 
 
 
498 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0356  aldehyde dehydrogenase  60.41 
 
 
489 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  53.44 
 
 
495 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  57 
 
 
495 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
495 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1909  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  58.45 
 
 
499 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.295691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  54.53 
 
 
495 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  54.53 
 
 
495 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
495 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
495 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.82 
 
 
498 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  54.53 
 
 
495 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  54.75 
 
 
497 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
495 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.79 
 
 
495 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
495 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.38 
 
 
509 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
497 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.12 
 
 
495 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  51 
 
 
499 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 
497 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.12 
 
 
495 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
497 aa  528  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0305  putative aldehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
496 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.67 
 
 
504 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1330  Aldehyde Dehydrogenase  58.94 
 
 
498 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174379  normal  0.217301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02680  putative aldehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.24739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 
493 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0566  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.36 
 
 
504 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  55.04 
 
 
495 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.03 
 
 
501 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  51.11 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  52.13 
 
 
492 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  50.51 
 
 
505 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  52.32 
 
 
500 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1689  Aldehyde Dehydrogenase  48.08 
 
 
500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 
498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5756  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.64 
 
 
497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969126  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  51.04 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09710  putative aldehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
496 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000831166  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2110  aldehyde dehydrogenase  48.58 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0052069  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  48.59 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4752  aldehyde dehydrogenase  50.81 
 
 
501 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  46.86 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1074  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.178667  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1171  aldehyde dehydrogenase family protein  50.53 
 
 
492 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>