69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0258 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  99.22 
 
 
638 aa  1280    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  65.99 
 
 
644 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  65.31 
 
 
640 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  68.59 
 
 
644 aa  867    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  66.93 
 
 
640 aa  874    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  66.35 
 
 
641 aa  863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  66.83 
 
 
644 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  99.22 
 
 
638 aa  1280    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  65.88 
 
 
638 aa  864    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  69.07 
 
 
641 aa  882    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  65.71 
 
 
630 aa  861    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  66.99 
 
 
644 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  65.71 
 
 
630 aa  861    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  69.07 
 
 
641 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  99.22 
 
 
638 aa  1280    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  68.2 
 
 
523 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  66.19 
 
 
638 aa  869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  99.22 
 
 
638 aa  1275    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  69.07 
 
 
641 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  68.48 
 
 
647 aa  888    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  66.35 
 
 
713 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  100 
 
 
638 aa  1286    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  67.4 
 
 
660 aa  899    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  68.32 
 
 
650 aa  889    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  99.22 
 
 
638 aa  1280    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  65.88 
 
 
638 aa  864    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  67.5 
 
 
643 aa  880    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  71.16 
 
 
638 aa  936    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  68.32 
 
 
650 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  66.35 
 
 
638 aa  868    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  99.37 
 
 
638 aa  1278    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  65.52 
 
 
640 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  66.67 
 
 
644 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  69.94 
 
 
645 aa  886    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  66.46 
 
 
711 aa  877    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  67.45 
 
 
644 aa  882    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  65.62 
 
 
640 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  68.59 
 
 
644 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  72.26 
 
 
638 aa  954    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  66.35 
 
 
641 aa  863    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  66.51 
 
 
641 aa  863    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  27.85 
 
 
743 aa  206  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 
708 aa  205  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  26.78 
 
 
663 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  27.19 
 
 
729 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  26.01 
 
 
727 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  26.03 
 
 
775 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  25.9 
 
 
722 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  25.9 
 
 
718 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  25.62 
 
 
727 aa  133  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  25.28 
 
 
761 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  23.82 
 
 
733 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  23.85 
 
 
733 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  23.47 
 
 
738 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  23.47 
 
 
738 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  24.9 
 
 
722 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  24.9 
 
 
669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  24.9 
 
 
669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  24.9 
 
 
669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  23.24 
 
 
738 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  23.23 
 
 
738 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  23.44 
 
 
730 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  23.09 
 
 
738 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  24.51 
 
 
738 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  23.97 
 
 
808 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.88 
 
 
305 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.18 
 
 
288 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  24.81 
 
 
1259 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  42 
 
 
405 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>