60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2060 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2060  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3295  hypothetical protein  64.21 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2441  hypothetical protein  64.21 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1518  hypothetical protein  64.21 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1287  hypothetical protein  64.21 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2016  hypothetical protein  64.21 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2540  hypothetical protein  64.21 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2397  hypothetical protein  63.16 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1850  hypothetical protein  54.17 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1570  hypothetical protein  49.46 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0958  hypothetical protein  43.43 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0479  hypothetical protein  43.43 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0920  hypothetical protein  45.26 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0055  hypothetical protein  43.43 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0819  hypothetical protein  41.41 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0828  hypothetical protein  41.41 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4059  hypothetical protein  42.42 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00670  hypothetical protein  42.42 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1995  hypothetical protein  44.21 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938278  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5053  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4777  hypothetical protein  43.16 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00674885  hitchhiker  0.00133084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2439  hypothetical protein  44.09 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1903  hypothetical protein  43.33 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3357  hypothetical protein  43.01 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.844459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0061  hypothetical protein  42.22 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0979  hypothetical protein  38.46 
 
 
170 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2989  hypothetical protein  43.43 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1091  hypothetical protein  39.36 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2000  hypothetical protein  40.21 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000379085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0858  hypothetical protein  39.78 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0923  hypothetical protein  39.78 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.52192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1303  hypothetical protein  37.63 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02104  hypothetical protein  36.56 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2808  hypothetical protein  40.62 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2687  hypothetical protein  33.7 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2424  hypothetical protein  35.79 
 
 
168 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1821  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2420  hypothetical protein  33.7 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1369  hypothetical protein  34.65 
 
 
167 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3710  hypothetical protein  31.18 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.617797  normal  0.6169 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06423  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269408  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1303  hypothetical protein  38.54 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4185  hypothetical protein  36.26 
 
 
165 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436089  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1896  hypothetical protein  36.46 
 
 
170 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0847  hypothetical protein  30.43 
 
 
168 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4974  hypothetical protein  32.32 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5006  hypothetical protein  36.17 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3410  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3857  hypothetical protein  35.79 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512206  normal  0.250482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3797  hypothetical protein  41.07 
 
 
174 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0238  hypothetical protein  29.91 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1532  hypothetical protein  31.96 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189027  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0562  hypothetical protein  35.35 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3056  hypothetical protein  38.3 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020297  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0235  hypothetical protein  28.97 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0241  hypothetical protein  28.97 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0235  hypothetical protein  28.97 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0345  hypothetical protein  28.97 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0239  hypothetical protein  32.67 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000143934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4492  hypothetical protein  32.67 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>