16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1989 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  692    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  99.41 
 
 
339 aa  688    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  74.93 
 
 
339 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  32.45 
 
 
325 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  26.28 
 
 
337 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  24.92 
 
 
338 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  27.38 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  23.84 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  22.9 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  28.79 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  27.27 
 
 
368 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  27.48 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  27.61 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  31.45 
 
 
395 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  23.7 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  25.86 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>