25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0910 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  530  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  61 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  30.49 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  30.49 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  32.32 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  27.94 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  28.79 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  26.61 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  33.73 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  27.12 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  29.25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  34.78 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  34.78 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  34.78 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40 
 
 		 197 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  32.86 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  26.89 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  33.77 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  35.14 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.16 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.74 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  36.49 
 
 		 174 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>