36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41800 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1282    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  42.1 
 
 
624 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  30.7 
 
 
633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  31.11 
 
 
618 aa  240  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  28.59 
 
 
603 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
623 aa  213  7e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  28.53 
 
 
580 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  28.2 
 
 
593 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  28.15 
 
 
624 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  28.14 
 
 
551 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
616 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  33.06 
 
 
770 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  25.92 
 
 
867 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  25.67 
 
 
654 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  24.75 
 
 
580 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  23.4 
 
 
673 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  26.29 
 
 
675 aa  127  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  24.81 
 
 
651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  23.06 
 
 
651 aa  120  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  22.96 
 
 
659 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  23.83 
 
 
584 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  25.67 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  28.89 
 
 
742 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  25.49 
 
 
619 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  23.23 
 
 
638 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  23.24 
 
 
692 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  23.27 
 
 
644 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  21.85 
 
 
1072 aa  65.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  22.47 
 
 
507 aa  53.9  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  21.58 
 
 
580 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.63 
 
 
481 aa  47.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  27.56 
 
 
582 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.36 
 
 
482 aa  47.4  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  23.83 
 
 
578 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  26.32 
 
 
473 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  23.97 
 
 
494 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>