More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  80.37 
 
 
642 aa  971    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  79.91 
 
 
642 aa  969    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  53.19 
 
 
640 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  79.5 
 
 
636 aa  946    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  79.03 
 
 
636 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 
639 aa  1272    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  53.19 
 
 
640 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  53.33 
 
 
641 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  80.31 
 
 
640 aa  950    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  53.33 
 
 
641 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  52.88 
 
 
638 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  80.37 
 
 
642 aa  971    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  53.33 
 
 
641 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  57.57 
 
 
631 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  52.96 
 
 
642 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  56.39 
 
 
645 aa  672    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  53.33 
 
 
641 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2140  ABC transporter ATP-binding protein  83.59 
 
 
640 aa  969    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  56.81 
 
 
637 aa  652    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  58.63 
 
 
650 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  85.78 
 
 
641 aa  1017    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  53.19 
 
 
640 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  53.19 
 
 
640 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  79.91 
 
 
642 aa  989    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  83.75 
 
 
640 aa  970    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  55.49 
 
 
640 aa  693    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  51.48 
 
 
632 aa  632  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  52.31 
 
 
641 aa  633  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  54.6 
 
 
635 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  55.82 
 
 
632 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  52.4 
 
 
649 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  51.39 
 
 
638 aa  625  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  51.41 
 
 
639 aa  628  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
637 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
637 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  51.47 
 
 
639 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
637 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  51.25 
 
 
640 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  52.66 
 
 
637 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  55.16 
 
 
643 aa  622  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  50.78 
 
 
639 aa  624  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  53.97 
 
 
639 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  52.25 
 
 
638 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  52.66 
 
 
635 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  52.66 
 
 
635 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  52.02 
 
 
635 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  52.66 
 
 
635 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  50.94 
 
 
639 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  52.02 
 
 
640 aa  618  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  52.66 
 
 
635 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  52.66 
 
 
635 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  51.25 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  52.5 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  48.21 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  51 
 
 
645 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  52.96 
 
 
648 aa  611  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  48.99 
 
 
646 aa  607  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  51.32 
 
 
642 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  50.93 
 
 
634 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  52.02 
 
 
635 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  52.02 
 
 
635 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  52.02 
 
 
635 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  52.58 
 
 
641 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  52.02 
 
 
635 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  52.02 
 
 
635 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  50.16 
 
 
636 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  52.73 
 
 
623 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  52.02 
 
 
635 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  51.87 
 
 
635 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  51.63 
 
 
641 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  52.7 
 
 
631 aa  596  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  51.25 
 
 
636 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  54.67 
 
 
637 aa  595  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  51.16 
 
 
642 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 
633 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
641 aa  587  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  49.45 
 
 
638 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
615 aa  588  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  46.83 
 
 
645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  53.2 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  52.51 
 
 
627 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  50.39 
 
 
663 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.79 
 
 
653 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  50.39 
 
 
636 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  51.25 
 
 
625 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  51.33 
 
 
594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
636 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3061  ABC transporter related  52.06 
 
 
663 aa  568  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0828579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  51.03 
 
 
626 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  47.17 
 
 
648 aa  567  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  51.48 
 
 
644 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0797  ABC transporter ATPase component  51.17 
 
 
644 aa  568  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  48.91 
 
 
641 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  47.17 
 
 
648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  48.27 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 
632 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  48.45 
 
 
645 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  53.05 
 
 
623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  52.9 
 
 
639 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  46.88 
 
 
626 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>