43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3953 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  75.19 
 
 		 219 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  85 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3814  hypothetical protein  86.84 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  47.74 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  69.41 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  46.23 
 
 		 241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  69.41 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  81.82 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  45.54 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  67.42 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  65.91 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  54.05 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  68.75 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  70.42 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  47.86 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  62.37 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  59.78 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  73.44 
 
 		 431 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  71.88 
 
 		 231 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  69.7 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  69.84 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  71.43 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  53.01 
 
 		 216 aa  96.3  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  49.18 
 
 		 144 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  38.46 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  54.95 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  45.36 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  56.25 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  56.25 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  56.25 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  47.13 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  60.66 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  48.72 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  45.98 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  51.85 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  53.85 
 
 		 143 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  43.59 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  41.56 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  42.86 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  60.47 
 
 		 674 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  63.04 
 
 		 723 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>