68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1775 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1775  acetyltransferase  100 
 
 
172 aa  356  8e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1525  GCN5-related N-acetyltransferase  53.61 
 
 
169 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1720  GCN5-related N-acetyltransferase  52.41 
 
 
169 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.547473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2291  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101571  normal  0.149434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1774  acetyltransferase  28.93 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3659  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  26.57 
 
 
171 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  27.55 
 
 
180 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  26.57 
 
 
171 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.64 
 
 
146 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93914  predicted protein  38.3 
 
 
269 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.24187  normal  0.275816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.89 
 
 
205 aa  45.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02392  hypothetical protein  24.05 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
291 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2109  hypothetical protein  33.8 
 
 
336 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2339  GCN5-like N-acetyltransferase  29.9 
 
 
200 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00797251  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
860 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0695  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0302476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2719  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0268  GCN5-related protein N-acetyltransferase  28.46 
 
 
312 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  hitchhiker  0.00359764 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  29.81 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  26.25 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  26.6 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0041  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  31.17 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.14 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
167 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  26.25 
 
 
145 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7207  acetyltransferase  24.21 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0084  GCN5-related N-acetyltransferase  26.57 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
139 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4561  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  24.39 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0519  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0541  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0529  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211339  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.25 
 
 
148 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1043  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
188 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1923  GCN5-related N-acetyltransferase  19.88 
 
 
186 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>