86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0011 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000281552  normal  0.938437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0007  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0047  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0023  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0002  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0011  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000337805  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05459  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna016  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000103361  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna009  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna117  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna043  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00325  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03029  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06826  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51230  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.037288  hitchhiker  0.000112039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0083  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t24  tRNA-OTHER  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108568  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565956  normal  0.627956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4383  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0799273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0471  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0067  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0084  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0117481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0059  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1123t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3159t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3157t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t51  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00175911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA25  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0856542  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0650354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R24  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.902283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0075  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0076  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>