141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4907 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  77.42 
 
 		 62 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  68.42 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.65 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  59.32 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  57.14 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  54.55 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  58.18 
 
 		 70 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  57.89 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  52.73 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  57.89 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  60.38 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.9 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  54.72 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  54.55 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.9 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  58.33 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  50 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  59.62 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  48.28 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  48.28 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.73 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  58.33 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  49.23 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  58.33 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.61 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  53.45 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  56.25 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  53.7 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  58.49 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.85 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  53.57 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  50 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  53.57 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  50.88 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  43.94 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  51.72 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  41.38 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  49.12 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  49.12 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  52.83 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  50.98 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.88 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  51.72 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  50 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  56 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  50.98 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  47.46 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  50.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.83 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  50.94 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  52 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  52 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  48.15 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00478  predicted RNA-binding protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3085  conserved hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000297466  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0629  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306723  normal  0.860883 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  41.38 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0569  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000593229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00483  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.325601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3094  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0573  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0326332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0446  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000152535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  51.92 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  48.28 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.83 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0587  hypothetical protein  47.37 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  49.09 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  45.28 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.66 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0985  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523788  normal  0.0666799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.66 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1672  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.66 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  39.66 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0594  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.705899  normal  0.0117354 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  38.24 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0589  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725964  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0649  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0586  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0256741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1042  hypothetical protein  44.07 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2942  hypothetical protein  44.07 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  45.61 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  43.1 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.66 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1157  hypothetical protein  42.11 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0334901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2510  hypothetical protein  43.33 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000911795  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2932  hypothetical protein  38.98 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.503316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2771  hypothetical protein  43.33 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00316834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>