24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2539 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  160  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  75 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  44.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  44.94 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  47.83 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  46.15 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  41.57 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  39.33 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  35.71 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  34.57 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  36.47 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  36.36 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  36.36 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  40 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.44 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.42 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.42 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  32.91 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  36.26 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  33.33 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.75 
 
 		 86 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  36.05 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>