24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4524 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  45.71 
 
 
298 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  45.71 
 
 
298 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  45.71 
 
 
298 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  39.73 
 
 
374 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  38.43 
 
 
788 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  39.91 
 
 
777 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  37.91 
 
 
270 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  37.91 
 
 
270 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  37.91 
 
 
270 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  32.47 
 
 
516 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38.68 
 
 
544 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  40.91 
 
 
190 aa  79  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  43.12 
 
 
511 aa  75.1  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  31.76 
 
 
852 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  36.46 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0310  antifungal protein precursor, putative  32.73 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.375674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.41 
 
 
1481 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2913  outer membrane protein  31.68 
 
 
301 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2757  hypothetical protein  31.68 
 
 
301 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0010  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38.04 
 
 
140 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584311  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1140  lectin  30.82 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.3 
 
 
1510 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1026  hypothetical protein  36.97 
 
 
388 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  decreased coverage  0.00589237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>