19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0987 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0987  CRISPR-associated protein, Cse2 family  100 
 
 		 190 aa  383  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0019  hypothetical protein  39.75 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3053  CRISPR-associated protein, Cse2 family  37.28 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1897  CRISPR-associated protein, Cse2 family  32.8 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1599  CRISPR-associated Cse2 family protein  31.33 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0275986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17190  CRISPR-associated Cse2 family protein  34.5 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.895123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2681  CRISPR-associated protein, Cse2 family  31.55 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000660236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3759  CRISPR-associated Cse2 family protein  35.62 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1534  Cse2 family CRISPR-associated protein  31.61 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3908  CRISPR-associated protein, Cse2 family  29.78 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000211783  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4092  CRISPR-associated protein, Cse2 family  28.21 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0761  CRISPR system CASCADE complex protein CasB  27.59 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0427302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2440  CRISPR-associated protein, Cse2 family  27.22 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2574  CRISPR-associated Cse2 family protein  32.91 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17340  CRISPR-associated protein, Cse2 family  34.39 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0649  CRISPR-associated Cse2 family protein  32.91 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0924  CRISPR-associated protein, Cse2 family  26.14 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1282  CRISPR-associated protein, Cse2 family  30.81 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2341  CRISPR-associated Cse2 family protein  26.62 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>