131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0038 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34442e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  98.61 
 
 
86 bp  135  2e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 
83 bp  119  1e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  93.42 
 
 
83 bp  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  93.42 
 
 
83 bp  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  94.44 
 
 
83 bp  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.9352e-06  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  92.31 
 
 
88 bp  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  91.86 
 
 
86 bp  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  92.31 
 
 
88 bp  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  93.15 
 
 
84 bp  97.6  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  92.21 
 
 
87 bp  97.6  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  93.15 
 
 
87 bp  97.6  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  93.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  91.03 
 
 
85 bp  93.7  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  92.86 
 
 
84 bp  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  93.24 
 
 
85 bp  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  91.55 
 
 
88 bp  87.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  93.33 
 
 
89 bp  85.7  2e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  90.54 
 
 
88 bp  85.7  2e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  91.89 
 
 
88 bp  83.8  6e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  81.8  2e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  89.86 
 
 
83 bp  81.8  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  90.67 
 
 
89 bp  79.8  1e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  97.73 
 
 
86 bp  79.8  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  75.8  1e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  75.8  1e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  75.8  1e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  75.8  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  75.8  1e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  75.8  1e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  90.54 
 
 
85 bp  75.8  1e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0012  tRNA-Leu  97.56 
 
 
88 bp  73.8  6e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  97.56 
 
 
88 bp  73.8  6e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1379  tRNA-Leu  97.56 
 
 
91 bp  73.8  6e-12  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.107567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  89.33 
 
 
89 bp  71.9  2e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  89.33 
 
 
86 bp  71.9  2e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  86.67 
 
 
83 bp  69.9  9e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  86.67 
 
 
83 bp  69.9  9e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  97.62 
 
 
89 bp  67.9  4e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  86.96 
 
 
83 bp  65.9  1e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0055  tRNA-Leu  88 
 
 
86 bp  63.9  6e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  97.44 
 
 
90 bp  61.9  2e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  95.24 
 
 
88 bp  60  9e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0016  tRNA-Leu  94 
 
 
85 bp  60  9e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0151  tRNA-Leu  94.59 
 
 
84 bp  58  3e-07  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0007  tRNA-Leu  94.59 
 
 
84 bp  58  3e-07  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  84.93 
 
 
83 bp  58  3e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  84.71 
 
 
87 bp  58  3e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  56  1e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0066  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  56  1e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  56  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0070  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  56  1e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  95 
 
 
89 bp  56  1e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  56  1e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  54  5e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  5e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  96.77 
 
 
83 bp  54  5e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  96.77 
 
 
83 bp  54  5e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  96.77 
 
 
83 bp  54  5e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  54  5e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  96.77 
 
 
86 bp  54  5e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  5.0044e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  5e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  96.77 
 
 
86 bp  54  5e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  2.17176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  96.77 
 
 
86 bp  54  5e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.89808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  54  5e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.77 
 
 
87 bp  54  5e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 
83 bp  52  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07180  tRNA-Leu  92.11 
 
 
89 bp  52  2e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.22258e-05  normal  0.69512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 
83 bp  52  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 
86 bp  52  2e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10180  tRNA-Leu  92.11 
 
 
89 bp  52  2e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.92924e-07  hitchhiker  4.70652e-07 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 
83 bp  52  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 
86 bp  52  2e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  2e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 
83 bp  52  2e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  52  2e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0026  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  52  2e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00329777  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  94.12 
 
 
83 bp  52  2e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  94.12 
 
 
86 bp  52  2e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0029  tRNA-Leu  92.11 
 
 
88 bp  52  2e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.98774e-05  normal  0.0770032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  9e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  9e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  9e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  8.80716e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  84.06 
 
 
86 bp  50.1  9e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0016  tRNA-Leu  84.93 
 
 
87 bp  50.1  9e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00811405  normal  0.0178437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  84.06 
 
 
86 bp  50.1  9e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  92.5 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  1.80291e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  83.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4910  tRNA-Leu  83.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00037453  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  83.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  83.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  6.45766e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  83.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  83.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>