73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0029 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000498774  normal  0.0770032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07180  tRNA-Leu  96.63 
 
 		 89 bp  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000122258  normal  0.69512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10180  tRNA-Leu  93.26 
 
 		 89 bp  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000392924  hitchhiker  0.000000470652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 84 bp  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0022  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.214962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0017  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0055  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924042  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0140  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180283  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1379  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.107567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0122  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000181545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0123  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0012  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03400  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06707  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna115  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000448705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna008  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000945853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3125t  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.556265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0256  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3379  hypothetical protein  93.33 
 
 		 174 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0099  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.116508  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1341  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  96.15 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>