More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1156 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
324 aa  650    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.78 
 
 
333 aa  318  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
333 aa  316  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1252  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.01 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.850982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0400  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.4 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.243821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0223  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.01 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.707619  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3055  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.65 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0810  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.09 
 
 
351 aa  298  7e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.128611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0337  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.69 
 
 
349 aa  295  7e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.112508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0568  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.93 
 
 
349 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.23 
 
 
349 aa  292  5e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0500  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.92 
 
 
349 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.927919  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.98 
 
 
330 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457574  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0143  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.26 
 
 
331 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.77 
 
 
343 aa  270  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454531  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0433  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.64 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2746  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.59 
 
 
329 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1625  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.05 
 
 
330 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0582  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.86 
 
 
340 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3493  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.81 
 
 
333 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1697  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.01 
 
 
322 aa  229  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1984  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.87 
 
 
323 aa  222  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0608348  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.33 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.4 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.82 
 
 
333 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.16 
 
 
340 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.57 
 
 
331 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.24 
 
 
337 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.37 
 
 
350 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.49 
 
 
333 aa  204  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.76 
 
 
348 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.51 
 
 
350 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.13 
 
 
369 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.58 
 
 
333 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.56 
 
 
345 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0738  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.7 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.2 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.51 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.21 
 
 
352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.42 
 
 
350 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.01 
 
 
346 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0399  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.69 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.862659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.59 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0142  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.89 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.36 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.05 
 
 
360 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.22 
 
 
347 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40 
 
 
348 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.22 
 
 
347 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.22 
 
 
347 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0072  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.77 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.38 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.96 
 
 
350 aa  195  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.33 
 
 
345 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2608  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.51 
 
 
345 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.09 
 
 
349 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.82 
 
 
340 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.2 
 
 
346 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.91 
 
 
345 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3848  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375893  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.54 
 
 
348 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1104  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.91 
 
 
339 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37 
 
 
345 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
351 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
351 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
351 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2702  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.19 
 
 
345 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00227816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.8 
 
 
339 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.62 
 
 
345 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.74 
 
 
359 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.03 
 
 
345 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.03 
 
 
345 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0680  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
351 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.03 
 
 
345 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.59 
 
 
346 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.9 
 
 
352 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0655  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
351 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.03 
 
 
345 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.05 
 
 
346 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.03 
 
 
345 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
345 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0075  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  32.46 
 
 
335 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496128  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.19 
 
 
350 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37 
 
 
345 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.74 
 
 
352 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.06 
 
 
344 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.7 
 
 
352 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37 
 
 
345 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.74 
 
 
352 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.7 
 
 
345 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.7 
 
 
345 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>