2137 genes were found for organism Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 22    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Plut_0001  CDS  NC_007512  284  1420  1137  DNA-directed DNA polymerase  YP_373936  hitchhiker  4.54197e-07  normal  0.662665  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0002  CDS  NC_007512  1555  2664  1110  RecF protein  YP_373937  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0003  CDS  NC_007512  2667  2960  294  hypothetical protein  YP_373938  normal  0.179596  normal  0.528651  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0004  CDS  NC_007512  3098  4321  1224  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  YP_373939  normal  0.351849  normal  0.58747  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0005  CDS  NC_007512  4402  6780  2379  DNA-directed DNA polymerase B  YP_373940  normal  0.775002  normal  0.276245  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0006  CDS  NC_007512  6887  8770  1884  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_373941  normal  normal  0.237557  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0007  CDS  NC_007512  8986  10773  1788  preprotein translocase subunit SecD  YP_373942  normal  normal  0.211478  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0008  CDS  NC_007512  10796  11731  936  preprotein translocase subunit SecF  YP_373943  normal  0.748405  normal  0.104556  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0009  CDS  NC_007512  11785  13104  1320  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  YP_373944  normal  0.227182  normal  0.108123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0010  CDS  NC_007512  13263  15197  1935  DNA gyrase, B subunit  YP_373945  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0011  CDS  NC_007512  15317  15943  627  ribonuclease HII  YP_373946  decreased coverage  1.50276e-09  normal  0.177364  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0012  CDS  NC_007512  16195  17907  1713  ribonuclease E and G  YP_373947  decreased coverage  3.76513e-06  normal  0.207191  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0013  CDS  NC_007512  17924  18787  864  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_373948  normal  0.028271  normal  0.297509  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0014  CDS  NC_007512  18792  20486  1695  peptidase S41A, C-terminal protease  YP_373949  normal  0.366239  normal  0.216554  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0015  CDS  NC_007512  20476  21171  696  hypothetical protein  YP_373950  normal  normal  0.321118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0016  CDS  NC_007512  21172  22314  1143  geranylgeranyl reductase  YP_373951  normal  0.828893  normal  0.344079  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0017  CDS  NC_007512  22335  23804  1470  glycyl-tRNA synthetase  YP_373952  normal  normal  0.606258  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0018  CDS  NC_007512  23865  24194  330  hypothetical protein  YP_373953  normal  normal  0.313448  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0019  CDS  NC_007512  24249  25199  951  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  YP_373954  normal  normal  0.215388  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0020  CDS  NC_007512  25266  25532  267  ATP synthase F1, epsilon subunit  YP_373955  normal  normal  0.118966  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0021  CDS  NC_007512  25546  26994  1449  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_373956  normal  normal  0.141679  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0022  CDS  NC_007512  27264  27791  528  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  YP_373957  normal  normal  0.117242  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0023  CDS  NC_007512  27941  29806  1866  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_373958  normal  normal  0.162015  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0024  CDS  NC_007512  29961  31346  1386  toluene transport protein, putative  YP_373959  normal  0.137484  normal  0.133309  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0025  CDS  NC_007512  31450  31728  279  hypothetical protein  YP_373960  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0026  CDS  NC_007512  31996  33567  1572  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  YP_373961  hitchhiker  0.00952912  normal  0.230083  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0027  CDS  NC_007512  33587  36454  2868  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  YP_373962  normal  0.0352248  normal  0.101653  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0030  CDS  NC_007512  37506  37934  429  hypothetical protein  YP_373963  hitchhiker  0.000157764  normal  0.0662308  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0031  CDS  NC_007512  38093  38602  510  hypothetical protein  YP_373964  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0032  CDS  NC_007512  38626  39099  474  rhodanese-like protein  YP_373965  hitchhiker  1.71668e-05  normal  0.0651616  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0033  CDS  NC_007512  39148  39384  237  hypothetical protein  YP_373966  hitchhiker  6.71264e-06  normal  0.064173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0034  CDS  NC_007512  39388  40824  1437  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  YP_373967  hitchhiker  0.000221087  normal  0.0809774  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0035  CDS  NC_007512  41104  41439  336  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  YP_373968  hitchhiker  5.08845e-08  normal  0.0334015  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0036  CDS  NC_007512  41498  42751  1254  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  YP_373969  hitchhiker  3.0158e-06  normal  0.0400699  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0037  CDS  NC_007512  42893  43972  1080  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  YP_373970  normal  0.0242217  normal  0.0801222  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0038  CDS  NC_007512  43990  45726  1737  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  YP_373971  normal  0.093726  normal  0.0842207  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0039  CDS  NC_007512  45713  46156  444  hypothetical protein  YP_373972  normal  0.221108  normal  0.777573  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0040  CDS  NC_007512  46203  46562  360  DsrE protein  YP_373973  normal  0.5054  normal  0.788589  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0041  CDS  NC_007512  46569  46937  369  DsrF protein  YP_373974  normal  0.630968  normal  0.80225  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0042  CDS  NC_007512  46995  47288  294  DsrH protein  YP_373975  normal  0.932533  normal  0.75194  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0043  CDS  NC_007512  47315  47758  444  hypothetical protein  YP_373976  normal  normal  0.798492  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0044  CDS  NC_007512  47755  48750  996  DsrM protein  YP_373977  normal  normal  0.877712  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0045  CDS  NC_007512  48753  50402  1650  DsrK protein  YP_373978  normal  normal  0.954015  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0046  CDS  NC_007512  50392  50772  381  hypothetical protein  YP_373979  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0047  CDS  NC_007512  50796  51527  732  polysulfide reductase, subunit B, putative  YP_373980  normal  normal  0.896881  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0048  CDS  NC_007512  51561  52736  1176  polysulfide reductase, subunit C, putative  YP_373981  normal  normal  0.939472  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0049  CDS  NC_007512  52733  53200  468  porphyrin biosynthesis protein, putative  YP_373982  normal  normal  0.843521  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0050  CDS  NC_007512  53176  54579  1404  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  YP_373983  normal  normal  0.929104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0051  CDS  NC_007512  54569  54832  264  hypothetical protein  YP_373984  normal  normal  0.758417  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0052  CDS  NC_007512  55086  55667  582  uridine kinase-like  YP_373985  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0053  CDS  NC_007512  55654  56949  1296  transporter, putative  YP_373986  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0054  CDS  NC_007512  56993  58612  1620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_373987  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0055  CDS  NC_007512  58625  59623  999  multidrug resistance protein A  YP_373988  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0056  CDS  NC_007512  59631  60104  474  universal stress protein  YP_373989  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0057  CDS  NC_007512  60101  61513  1413  outer membrane protein, putative  YP_373990  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0058  CDS  NC_007512  61643  63742  2100  Fis family transcriptional regulator  YP_373991  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0059  CDS  NC_007512  63849  64655  807  hypothetical protein  YP_373992  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0060  CDS  NC_007512  64659  65543  885  hypothetical protein  YP_373993  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0061  CDS  NC_007512  65604  66152  549  hypothetical protein  YP_373994  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0062  CDS  NC_007512  66171  66608  438  protein tyrosine phosphatase  YP_373995  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0063  CDS  NC_007512  66945  67412  468  hypothetical protein  YP_373996  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0064  CDS  NC_007512  67435  68628  1194  aminotransferase, class I  YP_373997  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0065  CDS  NC_007512  68647  69075  429  hypothetical protein  YP_373998  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0066  CDS  NC_007512  69092  70390  1299  phenylacetate--CoA ligase  YP_373999  normal  0.922632  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0067  CDS  NC_007512  70387  71004  618  indolepyruvate oxidoreductase subunit beta  YP_374000  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0068  CDS  NC_007512  71001  72599  1599  ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  YP_374001  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0069  CDS  NC_007512  72881  74107  1227  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  YP_374002  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0070  CDS  NC_007512  74132  75352  1221  anion-transporting ATPase  YP_374003  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0071  CDS  NC_007512  75653  77107  1455  sulfide-quinone reductase, putative  YP_374004  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0072  CDS  NC_007512  77167  77325  159  hypothetical protein  YP_374005  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0073  CDS  NC_007512  77673  78209  537  nitroreductase family protein  YP_374006  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0074  CDS  NC_007512  78206  78817  612  hypothetical protein  YP_374007  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0075  CDS  NC_007512  78868  79944  1077  peptide chain release factor 1  YP_374008  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0076  CDS  NC_007512  79962  81326  1365  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  YP_374009  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0077  CDS  NC_007512  81413  82561  1149  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_374010  normal  0.351849  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0078  CDS  NC_007512  82869  84989  2121  peptidase M41, FtsH  YP_374011  normal  0.0143352  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0079  CDS  NC_007512  85228  86052  825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  YP_374012  decreased coverage  0.000192992  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0080  CDS  NC_007512  86117  87961  1845  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_374013  normal  0.0166256  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0081  CDS  NC_007512  88013  88387  375  hypothetical protein  YP_374014  normal  0.831135  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0082  CDS  NC_007512  88529  90043  1515  hypothetical protein  YP_374015  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0083  CDS  NC_007512  90046  90429  384  hypothetical protein  YP_374016  normal  0.669157  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0084  CDS  NC_007512  90451  91059  609  hypothetical protein  YP_374017  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0085  CDS  NC_007512  91053  91322  270  hypothetical protein  YP_374018  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0086  CDS  NC_007512  91341  92648  1308  periplasmic protein  YP_374019  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0087  CDS  NC_007512  92766  93707  942  hypothetical protein  YP_374020  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0088  CDS  NC_007512  93825  94124  300  RNA recognition motif-containing protein  YP_374021  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0089  CDS  NC_007512  94422  95753  1332  ammonium transporter  YP_374022  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0090  CDS  NC_007512  95770  96111  342  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  YP_374023  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0091  CDS  NC_007512  96193  97104  912  peptidase C1A, papain  YP_374024  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0092  CDS  NC_007512  97111  97671  561  TPR repeat-containing protein  YP_374025  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0093  CDS  NC_007512  97897  98664  768  putative segregation and condensation protein A  YP_374026  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0094  CDS  NC_007512  98657  99931  1275  hypothetical protein  YP_374027  normal  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0095  CDS  NC_007512  99939  100379  441  hypothetical protein  YP_374028  normal  0.442138  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0096  CDS  NC_007512  100376  101080  705  protease, putative  YP_374029  normal  0.125274  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0097  CDS  NC_007512  101145  101540  396  Iojap-related protein  YP_374030  normal  0.0187008  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0098  CDS  NC_007512  101707  104154  2448  DNA gyrase, subunit A  YP_374031  normal  0.333525  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0099  CDS  NC_007512  104208  104441  234  Zn-finger, CDGSH type  YP_374032  normal  0.15953  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0100  CDS  NC_007512  104478  106271  1794  CTP synthetase  YP_374033  hitchhiker  0.000644202  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0101  CDS  NC_007512  106313  107329  1017  putative AefA  YP_374034  decreased coverage  1.59695e-08  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0102  CDS  NC_007512  112974  114662  1689  hypothetical protein  YP_374035  normal  0.037129  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 22    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>