129 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Teth514_0062  CDS  NC_010320  64485  64736  -  252  AbrB family transcriptional regulator  YP_001661720  unclonable  0.0000000000163043  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0063  CDS  NC_010320  64914  65498  +  585  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001661721  unclonable  0.0000000000780152  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0064  CDS  NC_010320  65504  66025  +  522  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001661722  unclonable  0.0000000000655497  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0065  CDS  NC_010320  66106  67509  +  1404  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  YP_001661723  unclonable  0.00000000449224  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0066  CDS  NC_010320  67845  69743  +  1899  methionyl-tRNA synthetase  YP_001661724  unclonable  0.0000000521971  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0113  CDS  NC_010320  109583  110011  +  429  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001661771  unclonable  0.0000000000598589  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0186  CDS  NC_010320  189215  189703  -  489  AsnC family transcriptional regulator  YP_001661841  unclonable  0.0000000000683645  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0414  CDS  NC_010320  425284  426111  +  828  transcriptional antiterminator, BglG  YP_001662060  unclonable  0.000000000657249  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0415  CDS  NC_010320  426243  427394  +  1152  trans-homoaconitate synthase  YP_001662061  unclonable  0.00000000279687  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0438  CDS  NC_010320  452228  453244  +  1017  alanine racemase  YP_001662084  unclonable  0.000000000864233  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0439  CDS  NC_010320  453299  453976  +  678  two component transcriptional regulator  YP_001662085  unclonable  0.000000000223011  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0440  CDS  NC_010320  453987  455387  +  1401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001662086  unclonable  0.000000011534  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0441  CDS  NC_010320  455485  456939  +  1455  hypothetical protein  YP_001662087  unclonable  0.0000000131637  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0442  CDS  NC_010320  456944  457456  -  513  hypothetical protein  YP_001662088  unclonable  0.000000000187912  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0443  CDS  NC_010320  457552  458091  +  540  hypothetical protein  YP_001662089  unclonable  0.000000000158208  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0444  CDS  NC_010320  458648  459151  +  504  rubrerythrin  YP_001662090  unclonable  0.000000000156568  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0445  CDS  NC_010320  459426  460613  +  1188  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001662091  unclonable  0.00000000309499  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0467  CDS  NC_010320  480076  480309  +  234  hypothetical protein  YP_001662113  unclonable  0.0000000000182221  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0468  CDS  NC_010320  480650  481432  +  783  extracellular solute-binding protein  YP_001662114  unclonable  0.000000000361301  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0477  CDS  NC_010320  487955  490648  +  2694  preprotein translocase subunit SecA  YP_001662123  unclonable  0.00000253416  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0485  CDS  NC_010320  499537  500478  +  942  carbamate kinase  YP_001662131  unclonable  0.000000000618454  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0486  CDS  NC_010320  500772  501356  +  585  membrane protein-like protein  YP_001662132  unclonable  0.0000000000983919  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0501  CDS  NC_010320  515005  515835  +  831  hypothetical protein  YP_001662147  unclonable  0.000000000873287  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0502  CDS  NC_010320  515837  516682  +  846  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  YP_001662148  unclonable  0.000000000986289  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0503    NC_010320  516672  518064  +  1393      unclonable  0.00000000639398  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0506  CDS  NC_010320  520243  521136  +  894  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  YP_001662150  unclonable  0.000000000424697  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0574  CDS  NC_010320  596970  598013  +  1044  integrase catalytic subunit  YP_001662218  unclonable  0.00000000257634  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0588  CDS  NC_010320  610218  610901  +  684  two component transcriptional regulator  YP_001662232  unclonable  0.000000000451147  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0589  CDS  NC_010320  610904  612316  +  1413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001662233  unclonable  0.0000000145863  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0590  CDS  NC_010320  612581  613942  +  1362  2-alkenal reductase  YP_001662234  unclonable  0.00000000722472  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0696  CDS  NC_010320  728132  728554  +  423  hypothetical protein  YP_001662339  unclonable  0.0000000000983919  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0755  CDS  NC_010320  783566  784597  -  1032  integrase catalytic subunit  YP_001662395  unclonable  0.00000000147635  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0810  CDS  NC_010320  842540  844039  +  1500  lysyl-tRNA synthetase  YP_001662449  unclonable  0.00000000714975  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0811  CDS  NC_010320  844432  844998  +  567  GTP cyclohydrolase I  YP_001662450  unclonable  0.0000000000676289  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0812  CDS  NC_010320  845011  845823  +  813  dihydropteroate synthase  YP_001662451  unclonable  0.000000000234542  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0844  CDS  NC_010320  881351  882808  +  1458  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001662483  unclonable  0.0000000194011  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0850  CDS  NC_010320  886863  887507  +  645  RNA polymerase factor sigma-70  YP_001662489  unclonable  0.000000000558431  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0851  CDS  NC_010320  887786  888988  +  1203  elongation factor Tu  YP_001662490  unclonable  0.00000000784672  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0852    NC_010320  889172  889318  +  147      unclonable  0.0000000000286593  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0853  CDS  NC_010320  889351  889506  +  156  preprotein translocase, SecE subunit  YP_001662491  unclonable  0.0000000000244118  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0854  CDS  NC_010320  889582  890106  +  525  transcription antitermination protein NusG  YP_001662492  unclonable  0.0000000000907525  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0855  CDS  NC_010320  890153  890575  +  423  50S ribosomal protein L11  YP_001662493  unclonable  0.0000000000662355  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0856  CDS  NC_010320  890622  891314  +  693  50S ribosomal protein L1  YP_001662494  unclonable  0.000000000185888  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0861  CDS  NC_010320  900082  900336  +  255  putative L7Ae-like ribosomal protein  YP_001662499  unclonable  0.0000000000301408  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0862  CDS  NC_010320  900364  900765  +  402  30S ribosomal protein S12  YP_001662500  unclonable  0.0000000000541183  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0863  CDS  NC_010320  900845  901315  +  471  30S ribosomal protein S7  YP_001662501  unclonable  0.0000000000741191  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0864  CDS  NC_010320  901365  903434  +  2070  elongation factor G  YP_001662502  unclonable  0.000000306199  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0865  CDS  NC_010320  903449  904651  +  1203  elongation factor Tu  YP_001662503  unclonable  0.00000000288327  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0866  CDS  NC_010320  904843  905151  +  309  30S ribosomal protein S10  YP_001662504  unclonable  0.0000000000610931  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0901  CDS  NC_010320  923223  923654  +  432  50S ribosomal protein L13  YP_001662539  unclonable  0.000000000118039  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0902  CDS  NC_010320  923669  924061  +  393  30S ribosomal protein S9  YP_001662540  unclonable  0.000000000079624  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0911  CDS  NC_010320  936941  937441  +  501  cation antiporter  YP_001662548  unclonable  0.0000000000489084  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0972  CDS  NC_010320  992027  993391  -  1365  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_001662609  unclonable  0.00000000730047  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0975  CDS  NC_010320  995708  997000  +  1293  homoserine dehydrogenase  YP_001662612  unclonable  0.00000000487265  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1041  CDS  NC_010320  1074046  1074651  +  606  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  YP_001662676  unclonable  0.000000000685221  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1141  CDS  NC_010320  1181978  1182571  +  594  metal dependent phosphohydrolase  YP_001662774  unclonable  0.000000000147329  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1142  CDS  NC_010320  1182640  1183113  +  474  ferric uptake regulator family protein  YP_001662775  unclonable  0.000000000076439  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1180  CDS  NC_010320  1215581  1217161  +  1581  alpha amylase, catalytic region  YP_001662810  unclonable  0.0000000265218  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1209  CDS  NC_010320  1249108  1250733  -  1626  alpha-glucan phosphorylase  YP_001662839  unclonable  0.00000000841932  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1232  CDS  NC_010320  1273383  1274510  +  1128  hypothetical protein  YP_001662862  unclonable  0.00000000219074  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1239  CDS  NC_010320  1281170  1282519  +  1350  SNF2-related protein  YP_001662869  unclonable  0.00000000294279  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1240  CDS  NC_010320  1282524  1282982  +  459  hypothetical protein  YP_001662870  unclonable  0.0000000000586496  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1294  CDS  NC_010320  1330993  1331649  +  657  putative transcriptional regulator  YP_001662923  unclonable  0.000000000197629  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1346  CDS  NC_010320  1382299  1383045  +  747  DNA repair protein RecO  YP_001662972  unclonable  0.000000000264775  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1347  CDS  NC_010320  1383060  1383470  +  411  ubiquitin-associated domain-containing protein  YP_001662973  unclonable  0.0000000000690799  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1348  CDS  NC_010320  1383580  1384968  +  1389  glycyl-tRNA synthetase  YP_001662974  unclonable  0.0000000102075  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1429  CDS  NC_010320  1463875  1464678  +  804  cell wall hydrolase, SleB  YP_001663054  unclonable  0.000000000499844  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1430  CDS  NC_010320  1464732  1465292  -  561  hypothetical protein  YP_001663055  unclonable  0.000000000236998  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1460  CDS  NC_010320  1492211  1493596  +  1386  radical SAM domain-containing protein  YP_001663085  unclonable  0.00000000686349  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1461  CDS  NC_010320  1493577  1494134  +  558  carbonic anhydrase  YP_001663086  unclonable  0.000000000178452  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1462  CDS  NC_010320  1494154  1495389  +  1236  preprotein translocase subunit SecD  YP_001663087  unclonable  0.00000000572302  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1467    NC_010320  1501101  1503259  +  2159      unclonable  0.000000346185  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1489  CDS  NC_010320  1521548  1524181  +  2634  alanyl-tRNA synthetase  YP_001663112  unclonable  0.00000163922  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1490  CDS  NC_010320  1524259  1524516  +  258  hypothetical protein  YP_001663113  unclonable  0.0000000000441821  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1491  CDS  NC_010320  1524572  1524991  +  420  Holliday junction resolvase-like protein  YP_001663114  unclonable  0.0000000000748947  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1492  CDS  NC_010320  1525071  1525355  +  285  hypothetical protein  YP_001663115  unclonable  0.000000000051458  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1493  CDS  NC_010320  1525579  1526019  +  441  ferric uptake regulator family protein  YP_001663116  unclonable  0.000000000138692  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1507  CDS  NC_010320  1539605  1539970  +  366  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  YP_001663130  unclonable  0.00000000010883  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1508  CDS  NC_010320  1540038  1540796  +  759  peptidase A24A domain-containing protein  YP_001663131  unclonable  0.000000000599925  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1539  CDS  NC_010320  1561845  1562444  +  600  hypothetical protein  YP_001663162  unclonable  0.000000000147329  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1616  CDS  NC_010320  1633378  1633845  +  468  ribonuclease H  YP_001663238  unclonable  0.000000000113365  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1617  CDS  NC_010320  1634023  1635015  +  993  site-specific tyrosine recombinase XerC  YP_001663239  unclonable  0.00000000155402  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1713  CDS  NC_010320  1720569  1721909  -  1341  signal recognition particle protein  YP_001663335  unclonable  0.00000000859311  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1722  CDS  NC_010320  1730679  1730906  -  228  acyl carrier protein  YP_001663344  unclonable  0.0000000000662355  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1723  CDS  NC_010320  1730949  1731692  -  744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001663345  unclonable  0.000000000657249  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1728  CDS  NC_010320  1735553  1736155  -  603  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  YP_001663350  unclonable  0.000000000185888  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1729  CDS  NC_010320  1736277  1736459  -  183  ribosomal protein L32  YP_001663351  unclonable  0.0000000000316991  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1730  CDS  NC_010320  1736477  1736962  -  486  hypothetical protein  YP_001663352  unclonable  0.000000000131873  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1731  CDS  NC_010320  1737034  1738239  -  1206  acetate kinase  YP_001663353  unclonable  0.00000000422881  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1743  CDS  NC_010320  1748813  1749163  -  351  hypothetical protein  YP_001663365  unclonable  0.0000000000509251  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1744  CDS  NC_010320  1749395  1749583  +  189  50S ribosomal protein L28  YP_001663366  unclonable  0.0000000000205787  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1774  CDS  NC_010320  1781587  1782468  -  882  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001663396  unclonable  0.00000000103729  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1957  CDS  NC_010320  1966054  1967097  -  1044  integrase catalytic subunit  YP_001663571  unclonable  0.0000000012554  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1998  CDS  NC_010320  2008095  2008571  -  477  transcriptional regulator NrdR  YP_001663606  unclonable  0.000000000130508  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1999  CDS  NC_010320  2008639  2008884  -  246  PRC-barrel domain-containing protein  YP_001663607  unclonable  0.0000000000479009  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2000  CDS  NC_010320  2008953  2009723  -  771  sporulation sigma factor SigG  YP_001663608  unclonable  0.000000000480045  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2056  CDS  NC_010320  2068061  2069302  -  1242  major facilitator transporter  YP_001663664  unclonable  0.00000000877049  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2057  CDS  NC_010320  2069405  2071309  -  1905  threonyl-tRNA synthetase  YP_001663665  unclonable  0.000000136416  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2064  CDS  NC_010320  2076985  2077188  -  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001663672  unclonable  0.0000000000424325  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2065  CDS  NC_010320  2077264  2078010  -  747  silent information regulator protein Sir2  YP_001663673  unclonable  0.000000000505079  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>