61 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Aave_0159  CDS  NC_008752  175361  177367  +  2007  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  YP_968545  normal  0.0741814  unclonable  0.0000000322464  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_0940  CDS  NC_008752  1022791  1024431  -  1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_969312  unclonable  0.000000958657  normal  0.647876  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1717  CDS  NC_008752  1877105  1877641  -  537  Arc domain-containing protein  YP_970078  decreased coverage  0.000000298141  unclonable  0.0000000100109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1718  CDS  NC_008752  1877991  1878941  +  951  hypothetical protein  YP_970079  hitchhiker  0.0000662496  unclonable  0.0000000124796  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1719  CDS  NC_008752  1879411  1879734  -  324  hypothetical protein  YP_970080  hitchhiker  0.000173431  unclonable  0.00000000861294  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1720  CDS  NC_008752  1879731  1880030  -  300  hypothetical protein  YP_970081  hitchhiker  0.000140414  unclonable  0.000000009426  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1910  CDS  NC_008752  2066933  2068207  -  1275  hypothetical protein  YP_970268  unclonable  0.0000000886145  decreased coverage  0.000282496  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2241  CDS  NC_008752  2461328  2462938  +  1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_970593  unclonable  0.000000611014  hitchhiker  0.00000521325  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2259  CDS  NC_008752  2485814  2486761  +  948  gluconolactonase  YP_970611  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2260  CDS  NC_008752  2486779  2487849  +  1071  aldose 1-epimerase  YP_970612  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2261  CDS  NC_008752  2487681  2492042  -  4362  hypothetical protein  YP_970613  normal  0.229571  unclonable  0.0000000683365  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2262  CDS  NC_008752  2492143  2493699  +  1557  glutamate-cysteine ligase  YP_970614  normal  0.0149794  unclonable  0.0000000142325  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2263  CDS  NC_008752  2493721  2495439  -  1719  thiamine pyrophosphate protein  YP_970615  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2264  CDS  NC_008752  2495594  2496751  +  1158  hypothetical protein  YP_970616  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2265  CDS  NC_008752  2496748  2497350  +  603  hypothetical protein  YP_970617  unclonable  0.0000000116311  hitchhiker  0.000000242252  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2335  CDS  NC_008752  2562387  2563124  -  738  putative phage repressor  YP_970685  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2336  CDS  NC_008752  2563204  2563464  +  261  hypothetical protein  YP_970686  hitchhiker  0.000126248  unclonable  0.0000000132594  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2337  CDS  NC_008752  2563457  2563756  +  300  hypothetical protein  YP_970687  hitchhiker  0.000138283  unclonable  0.0000000135301  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2338  CDS  NC_008752  2563756  2564112  +  357  hypothetical protein  YP_970688  hitchhiker  0.0000387966  unclonable  0.0000000142325  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2339  CDS  NC_008752  2564109  2565011  +  903  hypothetical protein  YP_970689  hitchhiker  0.0000444343  unclonable  0.0000000181907  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2340  CDS  NC_008752  2565005  2565796  +  792  hypothetical protein  YP_970690  decreased coverage  0.0000289954  unclonable  0.0000000185697  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2341    NC_008752  2565850  2566032  +  183      hitchhiker  0.000101278  unclonable  0.0000000131248  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2342  CDS  NC_008752  2566025  2566282  +  258  hypothetical protein  YP_970691  hitchhiker  0.00011614  unclonable  0.0000000129915  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2343  CDS  NC_008752  2566325  2567464  +  1140  hypothetical protein  YP_970692  normal  0.0268158  unclonable  0.0000000215974  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2344  CDS  NC_008752  2567631  2568074  +  444  hypothetical protein  YP_970693  hitchhiker  0.00444987  unclonable  0.0000000185697  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2345  CDS  NC_008752  2568279  2568785  +  507  hypothetical protein  YP_970694  hitchhiker  0.00537437  unclonable  0.0000000201289  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2346  CDS  NC_008752  2568775  2569239  +  465  hypothetical protein  YP_970695  hitchhiker  0.00450599  unclonable  0.0000000162621  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2347  CDS  NC_008752  2569236  2569499  +  264  hypothetical protein  YP_970696  hitchhiker  0.00243814  unclonable  0.0000000148287  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2348  CDS  NC_008752  2569499  2569990  +  492  hypothetical protein  YP_970697  hitchhiker  0.0016319  unclonable  0.0000000156083  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2349  CDS  NC_008752  2569990  2570307  +  318  hypothetical protein  YP_970698  hitchhiker  0.00258079  unclonable  0.0000000156083  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2350  CDS  NC_008752  2570311  2570913  +  603  hypothetical protein  YP_970699  normal  0.0494504  unclonable  0.0000000183812  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2351  CDS  NC_008752  2570987  2571313  +  327  hypothetical protein  YP_970700  normal  0.15574  unclonable  0.0000000142325  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2352  CDS  NC_008752  2571459  2572127  +  669  hypothetical protein  YP_970701  normal  1  unclonable  0.0000000174557  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2353  CDS  NC_008752  2572130  2573713  +  1584  putative terminase large subunit protein  YP_970702  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2354  CDS  NC_008752  2573787  2574209  +  423  hypothetical protein  YP_970703  normal  0.800105  unclonable  0.0000000146781  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2355  CDS  NC_008752  2574196  2576535  +  2340  hypothetical protein  YP_970704  normal  0.512259  unclonable  0.0000000418473  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2356  CDS  NC_008752  2576532  2577224  +  693  hypothetical protein  YP_970705  normal  0.0765973  unclonable  0.0000000169328  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2357  CDS  NC_008752  2577221  2577643  +  423  hypothetical protein  YP_970706  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2358  CDS  NC_008752  2577649  2578029  +  381  hypothetical protein  YP_970707  normal  0.255904  unclonable  0.0000000160936  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2359  CDS  NC_008752  2578016  2578429  +  414  hypothetical protein  YP_970708  normal  0.107687  unclonable  0.0000000154434  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2360  CDS  NC_008752  2578644  2579156  +  513  hypothetical protein  YP_970709  normal  0.0425703  unclonable  0.0000000154434  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2361  CDS  NC_008752  2579153  2579500  +  348  hypothetical protein  YP_970710  normal  0.0963888  unclonable  0.0000000142325  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2362  CDS  NC_008752  2579595  2580242  +  648  hypothetical protein  YP_970711  normal  0.0896802  unclonable  0.0000000151345  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2363  CDS  NC_008752  2580272  2581258  +  987  hypothetical protein  YP_970712  normal  0.240593  unclonable  0.0000000193357  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2364  CDS  NC_008752  2581258  2581461  +  204  hypothetical protein  YP_970713  normal  0.154851  unclonable  0.000000013945  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2365  CDS  NC_008752  2581515  2582630  +  1116  hypothetical protein  YP_970714  normal  0.267971  unclonable  0.0000000220383  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2366  CDS  NC_008752  2582666  2583124  +  459  hypothetical protein  YP_970715  normal  0.525857  unclonable  0.0000000157717  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2367  CDS  NC_008752  2583203  2583574  +  372  hypothetical protein  YP_970716  normal  0.484006  unclonable  0.0000000154434  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2368  CDS  NC_008752  2583581  2584201  +  621  hypothetical protein  YP_970717  normal  1  unclonable  0.0000000176384  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2369  CDS  NC_008752  2584192  2584821  +  630  hypothetical protein  YP_970718  normal  1  unclonable  0.0000000176384  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2370  CDS  NC_008752  2584893  2585309  +  417  hypothetical protein  YP_970719  normal  1  unclonable  0.000000013945  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2371  CDS  NC_008752  2585328  2586377  +  1050  hypothetical protein  YP_970720  normal  1  unclonable  0.0000000211653  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2372  CDS  NC_008752  2586379  2588388  +  2010  hypothetical protein  YP_970721  normal  1  unclonable  0.0000000329046  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2373  CDS  NC_008752  2588388  2588786  +  399  hypothetical protein  YP_970722  normal  0.288735  unclonable  0.0000000172785  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2374  CDS  NC_008752  2588827  2591403  +  2577  hypothetical protein  YP_970723  normal  0.0196318  unclonable  0.0000000506144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2375  CDS  NC_008752  2591400  2593331  +  1932  hypothetical protein  YP_970724  hitchhiker  0.00246528  unclonable  0.0000000374805  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2376  CDS  NC_008752  2593328  2593768  +  441  hypothetical protein  YP_970725  hitchhiker  0.00000344469  unclonable  0.0000000178231  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2377  CDS  NC_008752  2593960  2595000  +  1041  chromosome partitioning ATPase  YP_970726  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2769  CDS  NC_008752  3043575  3044084  +  510  hypothetical protein  YP_971111  unclonable  0.00000000878874  normal  1  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2770  CDS  NC_008752  3044123  3044515  -  393  hypothetical protein  YP_971112  unclonable  0.00000000436346  normal  1  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_4106  CDS  NC_008752  4563618  4564685  -  1068  ATPase domain-containing protein  YP_972421  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>