37 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tery_1230  CDS  NC_008312  1904238  1905296  +  1059  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  YP_721054  unclonable  0.0000000683761  normal  1  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_1571  CDS  NC_008312  2402846  2404927  -  2082  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_721324  unclonable  0.000060483  normal  1  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_1805  CDS  NC_008312  2753595  2754209  -  615  hypothetical protein  YP_721535  normal  1  unclonable  0.000048787  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_1806  CDS  NC_008312  2754328  2755920  -  1593  methionyl-tRNA synthetase  YP_721536  normal  1  unclonable  0.0000579293  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2112  CDS  NC_008312  3298305  3299189  -  885  UDP-glucose pyrophosphorylase  YP_721821  unclonable  0.0000000548517  normal  0.537185  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2325  CDS  NC_008312  3599249  3599467  +  219  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_722020  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2326  CDS  NC_008312  3600515  3601087  +  573  hypothetical protein  YP_722021  normal  0.0136683  unclonable  0.0000249209  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2327  CDS  NC_008312  3601653  3603533  +  1881  arsenite-activated ATPase ArsA  YP_722022  normal  0.761686  unclonable  0.000043688  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2474  CDS  NC_008312  3805467  3807194  -  1728  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_722156  unclonable  0.00000557801  normal  1  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2618  CDS  NC_008312  4043562  4045433  +  1872  GUN4-like  YP_722286  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2809  CDS  NC_008312  4358134  4361091  +  2958  tetratricopeptide TPR_2  YP_722458  unclonable  0.00683217  normal  1  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3031  CDS  NC_008312  4679856  4681199  +  1344  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  YP_722655  normal  0.542337  unclonable  0.0000310655  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3151  CDS  NC_008312  4808487  4810391  -  1905  ATPase AAA-2  YP_722754  hitchhiker  0.000310841  unclonable  0.0000497822  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3152  CDS  NC_008312  4810705  4811034  -  330  hypothetical protein  YP_722755  unclonable  0.00000000295489  unclonable  0.0000304444  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3300    NC_008312  5061694  5061903  +  210      unclonable  0.000000000539704  decreased coverage  0.00665451  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3352  CDS  NC_008312  5142563  5143429  -  867  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_722927  unclonable  0.0000000222923  normal  1  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3932  CDS  NC_008312  6076051  6078795  +  2745  WD-40 repeat-containing protein  YP_723436  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3933  CDS  NC_008312  6079121  6080560  +  1440  hypothetical protein  YP_723437  normal  0.218593  unclonable  0.0000403133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3934  CDS  NC_008312  6080614  6085413  +  4800  WD-40 repeat-containing protein  YP_723438  normal  0.146607  unclonable  0.000100505  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3936  CDS  NC_008312  6087348  6090377  -  3030  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  YP_723440  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4064  CDS  NC_008312  6276393  6276809  +  417  thioesterase superfamily protein  YP_723549  normal  1  unclonable  0.0000508078  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4065    NC_008312  6277513  6278315  +  803      normal  1  unclonable  0.0000545345  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4066  CDS  NC_008312  6278855  6279109  +  255  hypothetical protein  YP_723550  normal  0.502822  unclonable  0.0000502924  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4067  CDS  NC_008312  6279994  6281409  -  1416  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  YP_723551  normal  0.846169  unclonable  0.0000722409  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4068  CDS  NC_008312  6281793  6282737  -  945  O-succinylbenzoate synthase  YP_723552  normal  1  unclonable  0.0000591111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4069  CDS  NC_008312  6283409  6284266  -  858  alpha/beta hydrolase fold  YP_723553  normal  1  unclonable  0.0000534337  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4070  CDS  NC_008312  6284592  6284990  -  399  methionine-R-sulfoxide reductase  YP_723554  normal  1  unclonable  0.000043688  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4071  CDS  NC_008312  6285411  6286307  -  897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  YP_723555  normal  1  unclonable  0.000055647  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4072  CDS  NC_008312  6286709  6288205  +  1497  isochorismate synthases  YP_723556  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4073    NC_008312  6288606  6289677  -  1072      normal  1  unclonable  0.0000534337  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4074    NC_008312  6289940  6290182  +  243      normal  1  unclonable  0.0000399044  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4075  CDS  NC_008312  6290196  6290903  -  708  hypothetical protein  YP_723557  normal  0.982265  unclonable  0.0000432448  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4076  CDS  NC_008312  6290967  6291212  -  246  hypothetical protein  YP_723558  normal  0.895423  unclonable  0.0000371993  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4077  CDS  NC_008312  6291504  6293252  +  1749  2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3- cyclohexene-1-carboxylate synthase  YP_723559  normal  1  unclonable  0.0000513285  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4237  CDS  NC_008312  6542893  6546090  +  3198  helicase-like  YP_723710  unclonable  0.00803691  normal  1  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4806  CDS  NC_008312  7388112  7390736  -  2625  alanyl-tRNA synthetase  YP_724229  unclonable  0.00251805  normal  1  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_R0017  rRNA  NC_008312  3139115  3141995  +  2881  23S ribosomal RNA    unclonable  0.00563866  normal  0.094842  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>