26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ser-2 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0013  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315866  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0039  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0837952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0037  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0049  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0008  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0034  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0467968  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>