16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0143 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0143  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1162    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  29.58 
 
 
554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  34.57 
 
 
583 aa  100  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  23.32 
 
 
559 aa  89  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  28.43 
 
 
665 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0838  conserved hypothetical protein, KAP family  27.73 
 
 
607 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334041  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1427  hypothetical protein  27.71 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1510  KAP P-loop domain protein  30.69 
 
 
643 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.706242  decreased coverage  3.38847e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  28.26 
 
 
528 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  26.26 
 
 
608 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5557  hypothetical protein  18.32 
 
 
492 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1493  hypothetical protein  28.8 
 
 
624 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000440565  decreased coverage  0.000142627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  23.95 
 
 
606 aa  53.9  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  24.85 
 
 
210 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4211  KAP P-loop  24.47 
 
 
741 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.820288  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5554  hypothetical protein  45.83 
 
 
64 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.79575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>