16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5228 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  40.45 
 
 		 528 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  39.79 
 
 		 665 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1510  KAP P-loop domain protein  33.49 
 
 		 643 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.706242  decreased coverage  3.38847e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  34.27 
 
 		 608 aa  92.8  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4211  KAP P-loop  32.7 
 
 		 741 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.820288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0838  conserved hypothetical protein, KAP family  30.73 
 
 		 607 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334041  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3423  hypothetical protein  30.46 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145169 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1427  hypothetical protein  30.22 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413144  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  24.61 
 
 		 559 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  24.54 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  25.93 
 
 		 606 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1493  hypothetical protein  29.28 
 
 		 624 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000440565  decreased coverage  0.000142627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  27.46 
 
 		 554 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0143  hypothetical protein  24.56 
 
 		 571 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0052  hypothetical protein  35.9 
 
 		 588 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>