15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4211 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4211  KAP P-loop  100 
 
 		 741 aa  1538    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.820288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1510  KAP P-loop domain protein  29.6 
 
 		 643 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.706242  decreased coverage  3.38847e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  27.11 
 
 		 608 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  27.56 
 
 		 665 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  29.96 
 
 		 528 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  32.7 
 
 		 210 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  27.08 
 
 		 554 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1427  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1493  hypothetical protein  30.81 
 
 		 624 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000440565  decreased coverage  0.000142627 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  22.93 
 
 		 559 aa  56.2  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  27.67 
 
 		 606 aa  52  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0838  conserved hypothetical protein, KAP family  24.87 
 
 		 607 aa  52  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334041  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3423  hypothetical protein  23.08 
 
 		 579 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145169 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  25.56 
 
 		 583 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0143  hypothetical protein  24.47 
 
 		 571 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>