16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1510 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1510  KAP P-loop domain protein  100 
 
 
643 aa  1286    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.706242  decreased coverage  3.38847e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  28.06 
 
 
665 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4211  KAP P-loop  29.6 
 
 
741 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.820288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  26.32 
 
 
608 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  27.76 
 
 
528 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  33.68 
 
 
210 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1493  hypothetical protein  27.09 
 
 
624 aa  90.9  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000440565  decreased coverage  0.000142627 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  27.48 
 
 
559 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1427  hypothetical protein  26.79 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413144  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0838  conserved hypothetical protein, KAP family  29.21 
 
 
607 aa  67  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334041  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0143  hypothetical protein  30.69 
 
 
571 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  28.86 
 
 
554 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  28.98 
 
 
583 aa  58.9  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3423  hypothetical protein  27.65 
 
 
579 aa  53.9  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  22.56 
 
 
606 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5554  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.79575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>