17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0416 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1118    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  30.83 
 
 
554 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0838  conserved hypothetical protein, KAP family  34.85 
 
 
607 aa  114  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334041  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  34.91 
 
 
583 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1427  hypothetical protein  32.19 
 
 
449 aa  95.1  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0143  hypothetical protein  23.32 
 
 
571 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1510  KAP P-loop domain protein  27.48 
 
 
643 aa  87  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.706242  decreased coverage  3.38847e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  30 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  28.32 
 
 
665 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  26.61 
 
 
608 aa  73.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  24.61 
 
 
210 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  24.48 
 
 
606 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4211  KAP P-loop  23.57 
 
 
741 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.820288  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1493  hypothetical protein  25.68 
 
 
624 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000440565  decreased coverage  0.000142627 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0052  hypothetical protein  28.78 
 
 
588 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3423  hypothetical protein  25 
 
 
579 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  27.14 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>