27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3840 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3752  rhamnose-proton symporter  100 
 
 		 344 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0737  rhamnose-proton symporter  100 
 
 		 344 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.657475  normal  0.0373065 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3840  rhamnose-proton symporter  100 
 
 		 344 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4293  rhamnose-proton symporter  81.69 
 
 		 344 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4264  rhamnose-proton symporter  81.69 
 
 		 344 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.58807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4333  rhamnose-proton symporter  81.69 
 
 		 344 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0224713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4379  rhamnose-proton symporter  81.69 
 
 		 344 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4445  rhamnose-proton symporter  81.4 
 
 		 344 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03793  L-rhamnose:proton symporter  81.34 
 
 		 344 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03742  hypothetical protein  81.34 
 
 		 344 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4438  rhamnose-proton symporter  81.34 
 
 		 344 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4298  rhamnose-proton symporter  80.76 
 
 		 344 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.871805  normal  0.0209281 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4385  rhamnose-proton symporter  81.34 
 
 		 344 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4064  rhamnose-proton symporter  79.94 
 
 		 344 aa  576  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100273  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4077  L-rhamnose-proton symporter, RhaT family, DMT superfamily  79.88 
 
 		 344 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4110  rhamnose-proton symporter  80.17 
 
 		 344 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4137  rhamnose-proton symporter  79.88 
 
 		 344 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0511  rhamnose-proton symporter  80.17 
 
 		 344 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0430  rhamnose-proton symporter  79.36 
 
 		 344 aa  564  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4926  rhamnose-proton symporter  38.68 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000555456  normal  0.792801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1801  RhaT l-rhamnose-proton symport 2  36.73 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0563961  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4216  rhamnose-proton symporter  41.38 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09150  rhamnose-proton symporter  38.07 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1049  rhamnose-proton symporter  36.52 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4532  rhamnose-proton symporter  37.54 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3885  rhamnose-proton symporter  36.71 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3481  hypothetical protein  27.2 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>