96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3368 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0890  S-ribosylhomocysteinase  100 
 
 		 171 aa  357  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00237206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3368  S-ribosylhomocysteinase  100 
 
 		 171 aa  357  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000037261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3233  S-ribosylhomocysteinase  100 
 
 		 171 aa  357  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000982607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0848  S-ribosylhomocysteinase  90.06 
 
 		 171 aa  323  9e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000242687  hitchhiker  0.00000234466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2809  S-ribosylhomocysteinase  88.3 
 
 		 171 aa  322  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000667961  hitchhiker  0.00540149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02542  S-ribosylhomocysteinase  88.3 
 
 		 171 aa  321  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.244491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2970  S-ribosylhomocysteinase  88.3 
 
 		 171 aa  321  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00774095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2823  S-ribosylhomocysteinase  88.3 
 
 		 171 aa  321  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0355359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1020  S-ribosylhomocysteinase  88.3 
 
 		 171 aa  321  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219968  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02507  hypothetical protein  88.3 
 
 		 171 aa  321  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2966  S-ribosylhomocysteinase  87.72 
 
 		 171 aa  320  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.420255  hitchhiker  0.00077012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3018  S-ribosylhomocysteinase  87.72 
 
 		 171 aa  320  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000546652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3001  S-ribosylhomocysteinase  87.72 
 
 		 171 aa  320  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132801  hitchhiker  0.000413852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2935  S-ribosylhomocysteinase  87.72 
 
 		 171 aa  320  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0106447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3125  S-ribosylhomocysteinase  87.72 
 
 		 171 aa  320  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0152536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3932  S-ribosylhomocysteinase  87.72 
 
 		 171 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200839  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3189  S-ribosylhomocysteinase  87.72 
 
 		 171 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3167  S-ribosylhomocysteinase  88.3 
 
 		 171 aa  317  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1121  S-ribosylhomocysteinase  88.3 
 
 		 171 aa  317  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00787137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3206  S-ribosylhomocysteinase  87.13 
 
 		 171 aa  316  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0036281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0988  S-ribosylhomocysteinase  86.55 
 
 		 171 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1003  S-ribosylhomocysteinase  81.29 
 
 		 171 aa  298  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002532  S-ribosylhomocysteine lyase/autoinducer-2 production protein LuxS  78.36 
 
 		 172 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03484  S-ribosylhomocysteinase  77.19 
 
 		 172 aa  279  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1324  S-ribosylhomocysteinase  78.57 
 
 		 170 aa  278  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2541  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 169 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396089  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3432  S-ribosylhomocysteinase  74.56 
 
 		 169 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0091  S-ribosylhomocysteinase  72.51 
 
 		 172 aa  270  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.390825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3104  S-ribosylhomocysteinase  74.56 
 
 		 169 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0645  S-ribosylhomocysteinase  73.68 
 
 		 172 aa  269  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1101  S-ribosylhomocysteinase  73.96 
 
 		 169 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2882  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 169 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0397091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0922  S-ribosylhomocysteinase  73.96 
 
 		 169 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3440  S-ribosylhomocysteinase  73.96 
 
 		 169 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.232705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3565  S-ribosylhomocysteinase  73.96 
 
 		 169 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00065018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3368  S-ribosylhomocysteinase  73.96 
 
 		 169 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.556248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0972  S-ribosylhomocysteinase  73.37 
 
 		 169 aa  266  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000954809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0936  S-ribosylhomocysteinase  73.37 
 
 		 169 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0108992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0934  S-ribosylhomocysteinase  73.37 
 
 		 169 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00093245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0947  S-ribosylhomocysteinase  72.78 
 
 		 169 aa  265  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2129  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 173 aa  264  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.213782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3618  S-ribosylhomocysteinase  71.01 
 
 		 169 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0938  S-ribosylhomocysteinase  73.37 
 
 		 169 aa  263  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.35879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0981  S-ribosylhomocysteinase  70.24 
 
 		 169 aa  258  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0614202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0550  S-ribosylhomocysteinase  75.97 
 
 		 168 aa  257  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1213  S-ribosylhomocysteinase  73.91 
 
 		 164 aa  256  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1332  S-ribosylhomocysteinase  73.29 
 
 		 164 aa  256  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1938  S-ribosylhomocysteinase  71.69 
 
 		 167 aa  256  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1890  S-ribosylhomocysteine lyase  70.18 
 
 		 168 aa  254  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3371  S-ribosylhomocysteinase  69.23 
 
 		 169 aa  251  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1857  S-ribosylhomocysteinase  70.81 
 
 		 171 aa  250  6e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0531  S-ribosylhomocysteinase  69.57 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7692  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1053  S-ribosylhomocysteinase  68.94 
 
 		 171 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0111  S-ribosylhomocysteinase  67.47 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0546  S-ribosylhomocysteinase  67.7 
 
 		 164 aa  236  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.508205  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2248  S-ribosylhomocysteinase  43.51 
 
 		 155 aa  146  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0167  S-ribosylhomocysteinase  47.02 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0767  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  42.41 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.994692  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0171  S-ribosylhomocysteinase  46.36 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1059  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  42.31 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1562  S-ribosylhomocysteinase  45.03 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1662  S-ribosylhomocysteinase  40.4 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2049  S-ribosylhomocysteinase  44.52 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000875983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1586  S-ribosylhomocysteinase  40.4 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.169301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2208  S-ribosylhomocysteinase  43.84 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2170  S-ribosylhomocysteinase  43.84 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1741  S-ribosylhomocysteinase  42.38 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4626  S-ribosylhomocysteinase  41.72 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2789  S-ribosylhomocysteinase  41.72 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000788089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0322  S-ribosylhomocysteinase  41.72 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4917  S-ribosylhomocysteinase  41.72 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0910  S-ribosylhomocysteinase  40.67 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4946  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4931  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4687  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4525  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4544  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4911  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3461  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5047  S-ribosylhomocysteinase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1802  S-ribosylhomocysteinase  42 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1300  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  41.67 
 
 		 150 aa  117  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0305  S-ribosylhomocysteinase  39.35 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0583  S-ribosylhomocysteinase  41.89 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13210  S-ribosylhomocysteinase  39.04 
 
 		 157 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0440  S-ribosylhomocysteinase  38.51 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1054  S-ribosylhomocysteinase LuxS  38 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.48744 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0270  S-ribosylhomocysteinase  35.71 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.456853  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11080  S-ribosylhomocysteinase  34.76 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0630  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  30.87 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0889  S-ribosylhomocysteinase  35.8 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0379  S-ribosylhomocysteinase  31.69 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0654  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  28.57 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0261  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  32.7 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000185041  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1216  S-ribosylhomocysteinase  28.48 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0498  S-ribosylhomocysteinase  28.92 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.337432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>