96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2541 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2541  S-ribosylhomocysteinase  100 
 
 		 169 aa  353  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396089  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3565  S-ribosylhomocysteinase  88.76 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00065018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0936  S-ribosylhomocysteinase  88.17 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0108992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0922  S-ribosylhomocysteinase  88.76 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0934  S-ribosylhomocysteinase  88.17 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00093245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3368  S-ribosylhomocysteinase  88.76 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.556248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3440  S-ribosylhomocysteinase  88.76 
 
 		 169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.232705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0972  S-ribosylhomocysteinase  87.57 
 
 		 169 aa  317  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000954809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1101  S-ribosylhomocysteinase  87.57 
 
 		 169 aa  315  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0947  S-ribosylhomocysteinase  85.8 
 
 		 169 aa  313  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0938  S-ribosylhomocysteinase  86.39 
 
 		 169 aa  309  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.35879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3104  S-ribosylhomocysteinase  85.21 
 
 		 169 aa  307  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2882  S-ribosylhomocysteinase  84.02 
 
 		 169 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0397091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3432  S-ribosylhomocysteinase  81.66 
 
 		 169 aa  299  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3618  S-ribosylhomocysteinase  81.07 
 
 		 169 aa  297  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0091  S-ribosylhomocysteinase  81.07 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.390825  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002532  S-ribosylhomocysteine lyase/autoinducer-2 production protein LuxS  78.7 
 
 		 172 aa  289  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03484  S-ribosylhomocysteinase  77.51 
 
 		 172 aa  286  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1003  S-ribosylhomocysteinase  78.11 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311964  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0645  S-ribosylhomocysteinase  78.11 
 
 		 172 aa  285  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0988  S-ribosylhomocysteinase  78.11 
 
 		 171 aa  284  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2970  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  279  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00774095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1020  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  279  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219968  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2823  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  279  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0355359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02542  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  279  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.244491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02507  hypothetical protein  75.74 
 
 		 171 aa  279  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274904  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0981  S-ribosylhomocysteinase  76.79 
 
 		 169 aa  278  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0614202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2809  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  278  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000667961  hitchhiker  0.00540149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3932  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 171 aa  277  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200839  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0848  S-ribosylhomocysteinase  76.33 
 
 		 171 aa  277  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000242687  hitchhiker  0.00000234466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3189  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 171 aa  276  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3001  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132801  hitchhiker  0.000413852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2966  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.420255  hitchhiker  0.00077012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2935  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0106447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3125  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0152536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3018  S-ribosylhomocysteinase  75.74 
 
 		 171 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000546652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3206  S-ribosylhomocysteinase  74.56 
 
 		 171 aa  273  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0036281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3368  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 171 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000037261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3233  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 171 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000982607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0890  S-ribosylhomocysteinase  75.15 
 
 		 171 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00237206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1121  S-ribosylhomocysteinase  74.56 
 
 		 171 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00787137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1324  S-ribosylhomocysteinase  75.9 
 
 		 170 aa  271  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3167  S-ribosylhomocysteinase  74.56 
 
 		 171 aa  270  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3371  S-ribosylhomocysteinase  73.37 
 
 		 169 aa  266  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0550  S-ribosylhomocysteinase  74.84 
 
 		 168 aa  262  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2129  S-ribosylhomocysteinase  71.6 
 
 		 173 aa  257  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.213782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1890  S-ribosylhomocysteine lyase  70.66 
 
 		 168 aa  254  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1332  S-ribosylhomocysteinase  73.01 
 
 		 164 aa  253  8e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1053  S-ribosylhomocysteinase  70.81 
 
 		 171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1213  S-ribosylhomocysteinase  72.39 
 
 		 164 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1857  S-ribosylhomocysteinase  68.94 
 
 		 171 aa  250  8.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1938  S-ribosylhomocysteinase  72.39 
 
 		 167 aa  245  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0531  S-ribosylhomocysteinase  69.33 
 
 		 164 aa  244  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7692  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0546  S-ribosylhomocysteinase  66.87 
 
 		 164 aa  243  6e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.508205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0111  S-ribosylhomocysteinase  68.32 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0767  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  45.22 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.994692  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0171  S-ribosylhomocysteinase  47.37 
 
 		 151 aa  148  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0167  S-ribosylhomocysteinase  47.37 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2248  S-ribosylhomocysteinase  41.67 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1059  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  42.58 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1562  S-ribosylhomocysteinase  42.76 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1586  S-ribosylhomocysteinase  39.47 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.169301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1662  S-ribosylhomocysteinase  38.82 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1802  S-ribosylhomocysteinase  41.72 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0270  S-ribosylhomocysteinase  37.42 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.456853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0305  S-ribosylhomocysteinase  38.82 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1300  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  41.1 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0440  S-ribosylhomocysteinase  38.26 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2208  S-ribosylhomocysteinase  41.67 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2170  S-ribosylhomocysteinase  41.67 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0910  S-ribosylhomocysteinase  38.41 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1741  S-ribosylhomocysteinase  40.97 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2049  S-ribosylhomocysteinase  41.38 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000875983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2789  S-ribosylhomocysteinase  38.62 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000788089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13210  S-ribosylhomocysteinase  38.89 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4626  S-ribosylhomocysteinase  39.01 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4917  S-ribosylhomocysteinase  39.01 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0322  S-ribosylhomocysteinase  39.01 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1054  S-ribosylhomocysteinase LuxS  36.42 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.48744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4931  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4946  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4687  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4525  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4544  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5047  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4911  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3461  S-ribosylhomocysteinase  38.3 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0583  S-ribosylhomocysteinase  38.73 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0379  S-ribosylhomocysteinase  35.42 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11080  S-ribosylhomocysteinase  33.56 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0889  S-ribosylhomocysteinase  35.14 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0630  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  29.45 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0654  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  27.08 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0261  quorum-sensing autoinducer 2 (AI-2), LuxS  30.34 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000185041  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0498  S-ribosylhomocysteinase  27.11 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.337432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1216  S-ribosylhomocysteinase  28.38 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>