18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3208 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  374  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  55.26 
 
 
206 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  58.19 
 
 
197 aa  177  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  61.62 
 
 
227 aa  175  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  61.18 
 
 
194 aa  174  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  57.14 
 
 
204 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  54.88 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  46.07 
 
 
209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  50.57 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  49.71 
 
 
255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  49.4 
 
 
198 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  35.89 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  24.55 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  23.21 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  26.06 
 
 
212 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07661  hypothetical protein  34.67 
 
 
229 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.411925  hitchhiker  0.00185927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  28.79 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>