17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4794 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  59.66 
 
 
209 aa  203  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  51.98 
 
 
198 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  53.33 
 
 
201 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  42.31 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  43.78 
 
 
197 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  43.64 
 
 
194 aa  122  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  45.2 
 
 
255 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  41.54 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  46.24 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  33.53 
 
 
194 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  34.78 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  35.75 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  27.13 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  29.48 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  25.53 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2386  hypothetical protein  29.89 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>