17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3116 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  62.5 
 
 
206 aa  227  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  63.31 
 
 
227 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  59.12 
 
 
204 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  57.14 
 
 
194 aa  167  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  53.67 
 
 
255 aa  158  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  58.19 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  52.78 
 
 
198 aa  147  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  52.75 
 
 
201 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  43.78 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  45.61 
 
 
209 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  46.6 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  24.19 
 
 
222 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  26.4 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  21.15 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2386  hypothetical protein  22.34 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>