17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1905 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  373  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  46.6 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  48.85 
 
 
194 aa  140  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  44.57 
 
 
206 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  43.02 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  48.86 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  48.86 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  50.57 
 
 
199 aa  117  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  41.04 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  48.31 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  44.79 
 
 
201 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  34.78 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  31.82 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  24.44 
 
 
222 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  28.98 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  20.69 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2386  hypothetical protein  19.86 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>