17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0851 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  53.18 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  52.17 
 
 
209 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  50.83 
 
 
206 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  54.55 
 
 
194 aa  154  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  52.58 
 
 
197 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  53.33 
 
 
198 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  52.17 
 
 
255 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  52.22 
 
 
227 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  49.71 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  55.88 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  44.77 
 
 
190 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  32.79 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  23.67 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  24 
 
 
188 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  32.08 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2386  hypothetical protein  21.34 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>