194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0930 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0930  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.194996  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0222  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 
56 aa  82.8  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.441093  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0876  50S ribosomal protein L33  62.12 
 
 
56 aa  79.7  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29342  predicted protein  56.25 
 
 
60 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261696  normal  0.889457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3205  50S ribosomal protein L33P  58.73 
 
 
55 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0039  50S ribosomal protein L33  56.06 
 
 
55 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  53.97 
 
 
55 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0147  50S ribosomal protein L33  51.52 
 
 
55 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0204483  normal  0.0145707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3188  50S ribosomal protein L33  50.79 
 
 
55 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  53.97 
 
 
55 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7415  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0365906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  52.38 
 
 
55 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2947  50S ribosomal protein L33  47.62 
 
 
55 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0257  ribosomal protein L33  51.56 
 
 
59 aa  57.4  0.00000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.258757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2816  ribosomal protein L33  47.62 
 
 
55 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480398  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0847  50S ribosomal protein L33  46.03 
 
 
55 aa  57.4  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0388804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  42.42 
 
 
56 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1740  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33138  normal  0.392054 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  42.42 
 
 
56 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  49.12 
 
 
51 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1278  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.415692  normal  0.0543847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1771  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2107  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.680646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1996  ribosomal protein L33  39.39 
 
 
56 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.76258  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1350  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
55 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  45.45 
 
 
56 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 
51 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2414  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.63565  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3037  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
55 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
55 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1915  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  53.5  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001819  LSU ribosomal protein L33p  40.91 
 
 
56 aa  53.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000810994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00655  50S ribosomal protein L33  40.91 
 
 
56 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1499  50S ribosomal protein L33  46.03 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.612868  normal  0.102067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2235  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.015241 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0609  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  43.86 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1225  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  41.54 
 
 
55 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3540  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4292  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3676  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0498554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0574  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0547  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 
54 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2781  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690161  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0482  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 
54 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 
54 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1433  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3950  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 
54 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2441  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  45.61 
 
 
51 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  40.62 
 
 
54 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12292  predicted protein  43.28 
 
 
57 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.855117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
55 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4738  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0927  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876477  normal  0.594251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0588  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 
51 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.696444  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2340  50S ribosomal protein L33  43.86 
 
 
51 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  45.45 
 
 
56 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1751  50S ribosomal protein L33  41.27 
 
 
55 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2022  ribosomal protein L33  43.86 
 
 
51 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000144183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0464  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  41.38 
 
 
51 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70180  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0329  50S ribosomal protein L33  40.35 
 
 
57 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000323722  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6091  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 
51 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  40.62 
 
 
54 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  50.94 
 
 
57 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03239  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
55 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 
54 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2600  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 
55 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.19047e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1711  50S ribosomal protein L33  43.86 
 
 
51 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1990  50S ribosomal protein L33  43.86 
 
 
51 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  42.11 
 
 
51 aa  50.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0225  50S ribosomal protein L33  41.38 
 
 
51 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1887  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0670  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>