197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29342 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29342  predicted protein  100 
 
 
60 aa  120  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261696  normal  0.889457 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0222  50S ribosomal protein L33  62.96 
 
 
56 aa  72.4  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.441093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3205  50S ribosomal protein L33P  67.24 
 
 
55 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0876  50S ribosomal protein L33  62.96 
 
 
56 aa  72  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0930  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 
66 aa  67  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.194996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0482  50S ribosomal protein L33  63.04 
 
 
54 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0547  50S ribosomal protein L33  63.04 
 
 
54 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  55.56 
 
 
56 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12292  predicted protein  56.9 
 
 
57 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.855117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  60.34 
 
 
57 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0039  50S ribosomal protein L33  57.69 
 
 
55 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3188  50S ribosomal protein L33  55.77 
 
 
55 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  57.69 
 
 
55 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  56.9 
 
 
55 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0257  ribosomal protein L33  56.67 
 
 
59 aa  60.5  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.258757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  55.77 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  50 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  60.87 
 
 
51 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0147  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0204483  normal  0.0145707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03239  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2947  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  53.7 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 
51 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0049  50S ribosomal protein L33  56.52 
 
 
51 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7415  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0365906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 
51 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 
51 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0609  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3676  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0498554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  56.52 
 
 
51 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0574  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 
51 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 
51 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 
51 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0847  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0388804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  48.28 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 
51 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2723  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 
56 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0543  50S ribosomal protein L33  49.02 
 
 
54 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0519  50S ribosomal protein L33  49.02 
 
 
54 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2590  50S ribosomal protein L33P  48.28 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.493665  normal  0.155202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  58.7 
 
 
51 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 
51 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0588  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 
51 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.696444  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3950  50S ribosomal protein L33  56.52 
 
 
54 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  54.35 
 
 
51 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1751  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  53.45 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3385  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 
56 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.239871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0464  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6091  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 
51 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70180  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 
51 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0329  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000323722  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  51.72 
 
 
55 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0090  ribosomal protein L33  53.19 
 
 
51 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0225  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 
51 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1711  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 
51 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1453  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.7102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1990  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 
51 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  58.7 
 
 
54 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1350  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1383  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 
55 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.475862  normal  0.535543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2446  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2714  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2324  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
56 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1291  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070156  hitchhiker  0.00170848 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>