198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3205 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3205  50S ribosomal protein L33P  100 
 
 		 55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3188  50S ribosomal protein L33  67.27 
 
 		 55 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  69.09 
 
 		 55 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2816  ribosomal protein L33  69.09 
 
 		 55 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480398  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 55 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0147  50S ribosomal protein L33  67.27 
 
 		 55 aa  77.4  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0204483  normal  0.0145707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  69.09 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2947  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7415  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0365906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  67.27 
 
 		 55 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0039  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0847  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0388804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1499  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.612868  normal  0.102067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4292  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0222  50S ribosomal protein L33  66.04 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.441093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1350  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1278  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.415692  normal  0.0543847 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29342  predicted protein  67.24 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261696  normal  0.889457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0609  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3676  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0498554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0574  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1740  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33138  normal  0.392054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1771  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2107  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.680646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1751  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413593  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1433  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2781  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2441  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1291  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070156  hitchhiker  0.00170848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1383  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.475862  normal  0.535543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2414  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.63565  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2235  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.015241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3037  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4738  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0876  50S ribosomal protein L33  62.26 
 
 		 56 aa  68.6  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0927  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876477  normal  0.594251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1915  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3540  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0930  50S ribosomal protein L33  58.73 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.194996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1225  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1887  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0534  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0670  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672622 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 56 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2590  50S ribosomal protein L33P  52.73 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.493665  normal  0.155202 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1453  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.7102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0792  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.696109  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2648  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  59.57 
 
 		 56 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0547  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2871  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 56 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0482  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3950  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 54 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  61.7 
 
 		 51 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0543  50S ribosomal protein L33  58 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0519  50S ribosomal protein L33  58 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2140  ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 51 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1116  50S ribosomal protein L33P  50.91 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.283674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  50 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  56.52 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 51 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12292  predicted protein  53.7 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.855117  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0588  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.696444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 56 aa  57  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2446  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2714  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2324  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>