29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1500 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1500  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  150  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  42.67 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  42.67 
 
 
76 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1505  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  40.28 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  35.14 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0621  hypothetical protein  32.47 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121963  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0960  hypothetical protein  40.74 
 
 
86 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  41.18 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  32.39 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3381  hypothetical protein  32.47 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  38.89 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0667  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0661  hypothetical protein  31.17 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277375  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4549  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5185  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3290  hypothetical protein  29.87 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0343638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  32 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  32 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  26.39 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3218  hypothetical protein  44.59 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0721  hypothetical protein  48.39 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000996835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2122  hypothetical protein  29.76 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0518  hypothetical protein  39.58 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  34.62 
 
 
107 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>