53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1252 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  77.03 
 
 		 431 aa  688    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  76.1 
 
 		 431 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  70.64 
 
 		 436 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  80.74 
 
 		 431 aa  720    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  74.01 
 
 		 431 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  71.23 
 
 		 431 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 429 aa  885    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  80.74 
 
 		 431 aa  720    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  71 
 
 		 431 aa  644    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  73.78 
 
 		 431 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  80.28 
 
 		 431 aa  724    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  62.47 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  60.19 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  59.95 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  59.95 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  59.95 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  60.66 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  59.95 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  60.66 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  61.34 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  59.95 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  59.95 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  60.66 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  60.42 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  60.42 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  59.25 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  60.42 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  60.42 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  60.42 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  59.25 
 
 		 429 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  61.11 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  57.61 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  62.24 
 
 		 431 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  62.24 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  62.24 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  62.47 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  57.98 
 
 		 428 aa  504  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  56.81 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  56.31 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  54.91 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  53.76 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  49.39 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  44.94 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  45.71 
 
 		 436 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  45.71 
 
 		 436 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  43.88 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  43.88 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  45.95 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  45.7 
 
 		 431 aa  348  9e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  30.81 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  32.42 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  32.26 
 
 		 386 aa  203  6e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  33.44 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>